Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62.92■■■■■ 7.66
Jph4Q80WT0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.54■■■■■ 6.96
Jph4Q80WT0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.59■■■■■ 6.81
Jph4Q80WT0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.92■■■■■ 6.38
Jph4Q80WT0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.2■■■■■ 6.27
Jph4Q80WT0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
Jph4Q80WT0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.97■■■■■ 6.07
Jph4Q80WT0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
Jph4Q80WT0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
Jph4Q80WT0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
Jph4Q80WT0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.4■■■■■ 5.98
Jph4Q80WT0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51.47■■■■■ 5.83
Jph4Q80WT0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.94■■■■■ 5.75
Jph4Q80WT0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.94■■■■■ 5.75
Jph4Q80WT0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Jph4Q80WT0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
Jph4Q80WT0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
Jph4Q80WT0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.25■■■■■ 5.63
Jph4Q80WT0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
Jph4Q80WT0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
Jph4Q80WT0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
Jph4Q80WT0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
Jph4Q80WT0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
Jph4Q80WT0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Jph4Q80WT0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Jph4Q80WT0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
Jph4Q80WT0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Jph4Q80WT0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Jph4Q80WT0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Jph4Q80WT0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
Jph4Q80WT0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
Jph4Q80WT0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
Jph4Q80WT0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
Jph4Q80WT0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.17■■■■■ 5.3
Jph4Q80WT0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
Jph4Q80WT0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
Jph4Q80WT0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
Jph4Q80WT0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
Jph4Q80WT0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Jph4Q80WT0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Jph4Q80WT0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Jph4Q80WT0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
Jph4Q80WT0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.43■■■■■ 5.18
Jph4Q80WT0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Jph4Q80WT0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Jph4Q80WT0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Jph4Q80WT0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
Jph4Q80WT0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Jph4Q80WT0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
Jph4Q80WT0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Jph4Q80WT0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Jph4Q80WT0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Jph4Q80WT0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Jph4Q80WT0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Jph4Q80WT0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Jph4Q80WT0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Jph4Q80WT0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Jph4Q80WT0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Jph4Q80WT0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Jph4Q80WT0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Jph4Q80WT0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Jph4Q80WT0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Jph4Q80WT0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Jph4Q80WT0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Jph4Q80WT0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Jph4Q80WT0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Jph4Q80WT0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Jph4Q80WT0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Jph4Q80WT0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Jph4Q80WT0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
Jph4Q80WT0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Jph4Q80WT0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
Jph4Q80WT0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Jph4Q80WT0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Jph4Q80WT0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
Jph4Q80WT0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Jph4Q80WT0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
Jph4Q80WT0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Jph4Q80WT0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Jph4Q80WT0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
Jph4Q80WT0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Jph4Q80WT0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Jph4Q80WT0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Jph4Q80WT0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Jph4Q80WT0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
Jph4Q80WT0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45■■■■■ 4.79
Jph4Q80WT0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Jph4Q80WT0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Jph4Q80WT0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Jph4Q80WT0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Jph4Q80WT0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Jph4Q80WT0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Jph4Q80WT0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Jph4Q80WT0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Jph4Q80WT0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Jph4Q80WT0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Jph4Q80WT0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Jph4Q80WT0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms