Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Erich6bQ9D4S6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Erich6bQ9D4S6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Erich6bQ9D4S6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Erich6bQ9D4S6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Erich6bQ9D4S6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Erich6bQ9D4S6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Erich6bQ9D4S6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Erich6bQ9D4S6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Erich6bQ9D4S6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Erich6bQ9D4S6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Erich6bQ9D4S6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Erich6bQ9D4S6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Erich6bQ9D4S6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Erich6bQ9D4S6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Erich6bQ9D4S6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Erich6bQ9D4S6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Erich6bQ9D4S6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Erich6bQ9D4S6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich6bQ9D4S6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich6bQ9D4S6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich6bQ9D4S6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Erich6bQ9D4S6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Erich6bQ9D4S6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Erich6bQ9D4S6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Erich6bQ9D4S6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Erich6bQ9D4S6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Erich6bQ9D4S6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Erich6bQ9D4S6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Erich6bQ9D4S6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Erich6bQ9D4S6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich6bQ9D4S6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Erich6bQ9D4S6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Erich6bQ9D4S6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Erich6bQ9D4S6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Erich6bQ9D4S6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Erich6bQ9D4S6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Erich6bQ9D4S6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Erich6bQ9D4S6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Erich6bQ9D4S6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Erich6bQ9D4S6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Erich6bQ9D4S6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Erich6bQ9D4S6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Erich6bQ9D4S6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Erich6bQ9D4S6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Erich6bQ9D4S6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Erich6bQ9D4S6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Erich6bQ9D4S6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Erich6bQ9D4S6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Erich6bQ9D4S6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Erich6bQ9D4S6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Erich6bQ9D4S6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Erich6bQ9D4S6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Erich6bQ9D4S6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Erich6bQ9D4S6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Erich6bQ9D4S6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Erich6bQ9D4S6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich6bQ9D4S6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Erich6bQ9D4S6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Erich6bQ9D4S6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Erich6bQ9D4S6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Erich6bQ9D4S6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Erich6bQ9D4S6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Erich6bQ9D4S6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Erich6bQ9D4S6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Erich6bQ9D4S6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Erich6bQ9D4S6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Erich6bQ9D4S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Erich6bQ9D4S6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Erich6bQ9D4S6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Erich6bQ9D4S6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Erich6bQ9D4S6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Erich6bQ9D4S6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Erich6bQ9D4S6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Erich6bQ9D4S6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Erich6bQ9D4S6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Erich6bQ9D4S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Erich6bQ9D4S6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Erich6bQ9D4S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Erich6bQ9D4S6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Erich6bQ9D4S6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Erich6bQ9D4S6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Erich6bQ9D4S6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Erich6bQ9D4S6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Erich6bQ9D4S6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Erich6bQ9D4S6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Erich6bQ9D4S6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Erich6bQ9D4S6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Erich6bQ9D4S6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Erich6bQ9D4S6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Erich6bQ9D4S6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Erich6bQ9D4S6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Erich6bQ9D4S6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Erich6bQ9D4S6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Erich6bQ9D4S6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Erich6bQ9D4S6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Erich6bQ9D4S6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Erich6bQ9D4S6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Erich6bQ9D4S6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Erich6bQ9D4S6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms