Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.64■■■■■ 5.86
Dcaf11Q91VU6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Dcaf11Q91VU6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Dcaf11Q91VU6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Dcaf11Q91VU6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
Dcaf11Q91VU6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
Dcaf11Q91VU6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Dcaf11Q91VU6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Dcaf11Q91VU6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Dcaf11Q91VU6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Dcaf11Q91VU6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Dcaf11Q91VU6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Dcaf11Q91VU6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Dcaf11Q91VU6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Dcaf11Q91VU6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Dcaf11Q91VU6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Dcaf11Q91VU6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Dcaf11Q91VU6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Dcaf11Q91VU6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
Dcaf11Q91VU6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Dcaf11Q91VU6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Dcaf11Q91VU6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Dcaf11Q91VU6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Dcaf11Q91VU6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Dcaf11Q91VU6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Dcaf11Q91VU6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Dcaf11Q91VU6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Dcaf11Q91VU6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Dcaf11Q91VU6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Dcaf11Q91VU6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Dcaf11Q91VU6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Dcaf11Q91VU6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Dcaf11Q91VU6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Dcaf11Q91VU6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Dcaf11Q91VU6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Dcaf11Q91VU6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Dcaf11Q91VU6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Dcaf11Q91VU6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Dcaf11Q91VU6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Dcaf11Q91VU6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Dcaf11Q91VU6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Dcaf11Q91VU6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Dcaf11Q91VU6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Dcaf11Q91VU6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Dcaf11Q91VU6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Dcaf11Q91VU6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Dcaf11Q91VU6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Dcaf11Q91VU6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Dcaf11Q91VU6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Dcaf11Q91VU6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Dcaf11Q91VU6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Dcaf11Q91VU6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Dcaf11Q91VU6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Dcaf11Q91VU6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Dcaf11Q91VU6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Dcaf11Q91VU6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Dcaf11Q91VU6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Dcaf11Q91VU6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Dcaf11Q91VU6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Dcaf11Q91VU6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Dcaf11Q91VU6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Dcaf11Q91VU6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Dcaf11Q91VU6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Dcaf11Q91VU6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Dcaf11Q91VU6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Dcaf11Q91VU6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Dcaf11Q91VU6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Dcaf11Q91VU6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Dcaf11Q91VU6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Dcaf11Q91VU6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Dcaf11Q91VU6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Dcaf11Q91VU6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Dcaf11Q91VU6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Dcaf11Q91VU6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Dcaf11Q91VU6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Dcaf11Q91VU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Dcaf11Q91VU6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Dcaf11Q91VU6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Dcaf11Q91VU6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Dcaf11Q91VU6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Dcaf11Q91VU6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Dcaf11Q91VU6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Dcaf11Q91VU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Dcaf11Q91VU6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Dcaf11Q91VU6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Dcaf11Q91VU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Dcaf11Q91VU6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Dcaf11Q91VU6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Dcaf11Q91VU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Dcaf11Q91VU6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Dcaf11Q91VU6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Dcaf11Q91VU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Dcaf11Q91VU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Dcaf11Q91VU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Dcaf11Q91VU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Dcaf11Q91VU6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Dcaf11Q91VU6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Dcaf11Q91VU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Dcaf11Q91VU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Dcaf11Q91VU6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms