Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC67.9■■■■■ 8.46
Lamc3Q9R0B6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC63.2■■■■■ 7.71
Lamc3Q9R0B6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.9■■■■■ 7.5
Lamc3Q9R0B6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC59.37■■■■■ 7.09
Lamc3Q9R0B6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC58.76■■■■■ 7
Lamc3Q9R0B6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC57.57■■■■■ 6.81
Lamc3Q9R0B6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.44■■■■■ 6.79
Lamc3Q9R0B6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.03■■■■■ 6.72
Lamc3Q9R0B6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC56.92■■■■■ 6.7
Lamc3Q9R0B6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.82■■■■■ 6.69
Lamc3Q9R0B6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC56.54■■■■■ 6.64
Lamc3Q9R0B6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC55.37■■■■■ 6.45
Lamc3Q9R0B6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC54.9■■■■■ 6.38
Lamc3Q9R0B6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
Lamc3Q9R0B6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC54.77■■■■■ 6.36
Lamc3Q9R0B6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
Lamc3Q9R0B6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
Lamc3Q9R0B6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.28■■■■■ 6.28
Lamc3Q9R0B6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC54.12■■■■■ 6.25
Lamc3Q9R0B6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
Lamc3Q9R0B6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
Lamc3Q9R0B6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
Lamc3Q9R0B6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC53.81■■■■■ 6.2
Lamc3Q9R0B6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC53.75■■■■■ 6.2
Lamc3Q9R0B6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
Lamc3Q9R0B6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.83■■■■■ 6.05
Lamc3Q9R0B6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.8■■■■■ 6.04
Lamc3Q9R0B6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.71■■■■■ 6.03
Lamc3Q9R0B6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.68■■■■■ 6.02
Lamc3Q9R0B6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
Lamc3Q9R0B6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
Lamc3Q9R0B6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.29■■■■■ 5.96
Lamc3Q9R0B6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
Lamc3Q9R0B6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
Lamc3Q9R0B6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
Lamc3Q9R0B6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC52.04■■■■■ 5.92
Lamc3Q9R0B6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC52.02■■■■■ 5.92
Lamc3Q9R0B6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC52.01■■■■■ 5.92
Lamc3Q9R0B6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC51.66■■■■■ 5.86
Lamc3Q9R0B6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
Lamc3Q9R0B6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC51.35■■■■■ 5.81
Lamc3Q9R0B6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
Lamc3Q9R0B6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
Lamc3Q9R0B6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
Lamc3Q9R0B6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Lamc3Q9R0B6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.74
Lamc3Q9R0B6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.93■■■■■ 5.74
Lamc3Q9R0B6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
Lamc3Q9R0B6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
Lamc3Q9R0B6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
Lamc3Q9R0B6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
Lamc3Q9R0B6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
Lamc3Q9R0B6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
Lamc3Q9R0B6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
Lamc3Q9R0B6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
Lamc3Q9R0B6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
Lamc3Q9R0B6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
Lamc3Q9R0B6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Lamc3Q9R0B6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Lamc3Q9R0B6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Lamc3Q9R0B6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
Lamc3Q9R0B6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC49.8■■■■■ 5.56
Lamc3Q9R0B6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
Lamc3Q9R0B6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
Lamc3Q9R0B6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
Lamc3Q9R0B6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
Lamc3Q9R0B6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Lamc3Q9R0B6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Lamc3Q9R0B6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC49.34■■■■■ 5.49
Lamc3Q9R0B6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
Lamc3Q9R0B6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
Lamc3Q9R0B6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
Lamc3Q9R0B6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
Lamc3Q9R0B6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
Lamc3Q9R0B6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
Lamc3Q9R0B6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
Lamc3Q9R0B6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48.98■■■■■ 5.43
Lamc3Q9R0B6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
Lamc3Q9R0B6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC48.81■■■■■ 5.4
Lamc3Q9R0B6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Lamc3Q9R0B6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Lamc3Q9R0B6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Lamc3Q9R0B6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Lamc3Q9R0B6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Lamc3Q9R0B6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Lamc3Q9R0B6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Lamc3Q9R0B6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
Lamc3Q9R0B6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
Lamc3Q9R0B6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Lamc3Q9R0B6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
Lamc3Q9R0B6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Lamc3Q9R0B6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Lamc3Q9R0B6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms