Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ChgaP26339 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
ChgaP26339 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ChgaP26339 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ChgaP26339 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ChgaP26339 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ChgaP26339 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ChgaP26339 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ChgaP26339 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ChgaP26339 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ChgaP26339 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ChgaP26339 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ChgaP26339 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ChgaP26339 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ChgaP26339 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ChgaP26339 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ChgaP26339 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ChgaP26339 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ChgaP26339 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ChgaP26339 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ChgaP26339 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ChgaP26339 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ChgaP26339 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ChgaP26339 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ChgaP26339 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ChgaP26339 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ChgaP26339 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ChgaP26339 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ChgaP26339 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ChgaP26339 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ChgaP26339 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ChgaP26339 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ChgaP26339 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ChgaP26339 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ChgaP26339 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ChgaP26339 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ChgaP26339 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ChgaP26339 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ChgaP26339 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ChgaP26339 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ChgaP26339 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ChgaP26339 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ChgaP26339 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ChgaP26339 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ChgaP26339 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ChgaP26339 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ChgaP26339 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ChgaP26339 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ChgaP26339 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ChgaP26339 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ChgaP26339 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ChgaP26339 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ChgaP26339 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ChgaP26339 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ChgaP26339 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ChgaP26339 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ChgaP26339 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ChgaP26339 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ChgaP26339 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ChgaP26339 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ChgaP26339 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ChgaP26339 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ChgaP26339 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ChgaP26339 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ChgaP26339 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ChgaP26339 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ChgaP26339 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ChgaP26339 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ChgaP26339 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ChgaP26339 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ChgaP26339 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ChgaP26339 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ChgaP26339 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ChgaP26339 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ChgaP26339 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ChgaP26339 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ChgaP26339 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ChgaP26339 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ChgaP26339 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ChgaP26339 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ChgaP26339 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ChgaP26339 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ChgaP26339 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ChgaP26339 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ChgaP26339 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ChgaP26339 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ChgaP26339 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ChgaP26339 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ChgaP26339 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ChgaP26339 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ChgaP26339 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ChgaP26339 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ChgaP26339 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ChgaP26339 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ChgaP26339 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ChgaP26339 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ChgaP26339 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ChgaP26339 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
ChgaP26339 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ChgaP26339 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1172.4 ms