Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.29■■■■■ 5
Rwdd1Q9CQK7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Rwdd1Q9CQK7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Rwdd1Q9CQK7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Rwdd1Q9CQK7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Rwdd1Q9CQK7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rwdd1Q9CQK7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Rwdd1Q9CQK7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Rwdd1Q9CQK7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rwdd1Q9CQK7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Rwdd1Q9CQK7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rwdd1Q9CQK7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rwdd1Q9CQK7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Rwdd1Q9CQK7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rwdd1Q9CQK7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rwdd1Q9CQK7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rwdd1Q9CQK7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rwdd1Q9CQK7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rwdd1Q9CQK7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Rwdd1Q9CQK7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Rwdd1Q9CQK7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rwdd1Q9CQK7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rwdd1Q9CQK7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rwdd1Q9CQK7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rwdd1Q9CQK7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Rwdd1Q9CQK7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rwdd1Q9CQK7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rwdd1Q9CQK7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rwdd1Q9CQK7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rwdd1Q9CQK7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rwdd1Q9CQK7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rwdd1Q9CQK7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rwdd1Q9CQK7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rwdd1Q9CQK7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rwdd1Q9CQK7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rwdd1Q9CQK7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rwdd1Q9CQK7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Rwdd1Q9CQK7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rwdd1Q9CQK7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rwdd1Q9CQK7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rwdd1Q9CQK7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rwdd1Q9CQK7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rwdd1Q9CQK7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rwdd1Q9CQK7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rwdd1Q9CQK7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rwdd1Q9CQK7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Rwdd1Q9CQK7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rwdd1Q9CQK7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rwdd1Q9CQK7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rwdd1Q9CQK7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rwdd1Q9CQK7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rwdd1Q9CQK7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rwdd1Q9CQK7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rwdd1Q9CQK7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rwdd1Q9CQK7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rwdd1Q9CQK7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rwdd1Q9CQK7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rwdd1Q9CQK7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rwdd1Q9CQK7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rwdd1Q9CQK7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rwdd1Q9CQK7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rwdd1Q9CQK7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rwdd1Q9CQK7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rwdd1Q9CQK7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Rwdd1Q9CQK7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rwdd1Q9CQK7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rwdd1Q9CQK7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rwdd1Q9CQK7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rwdd1Q9CQK7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rwdd1Q9CQK7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rwdd1Q9CQK7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rwdd1Q9CQK7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rwdd1Q9CQK7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rwdd1Q9CQK7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rwdd1Q9CQK7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rwdd1Q9CQK7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rwdd1Q9CQK7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rwdd1Q9CQK7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rwdd1Q9CQK7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rwdd1Q9CQK7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rwdd1Q9CQK7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rwdd1Q9CQK7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rwdd1Q9CQK7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rwdd1Q9CQK7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rwdd1Q9CQK7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rwdd1Q9CQK7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rwdd1Q9CQK7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms