Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ipo8Q7TMY7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Ipo8Q7TMY7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ipo8Q7TMY7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
Ipo8Q7TMY7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Ipo8Q7TMY7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ipo8Q7TMY7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ipo8Q7TMY7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ipo8Q7TMY7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ipo8Q7TMY7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ipo8Q7TMY7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ipo8Q7TMY7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ipo8Q7TMY7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ipo8Q7TMY7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ipo8Q7TMY7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ipo8Q7TMY7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Ipo8Q7TMY7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ipo8Q7TMY7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ipo8Q7TMY7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ipo8Q7TMY7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ipo8Q7TMY7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Ipo8Q7TMY7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ipo8Q7TMY7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ipo8Q7TMY7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ipo8Q7TMY7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ipo8Q7TMY7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ipo8Q7TMY7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ipo8Q7TMY7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Ipo8Q7TMY7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Ipo8Q7TMY7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ipo8Q7TMY7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ipo8Q7TMY7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ipo8Q7TMY7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ipo8Q7TMY7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ipo8Q7TMY7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ipo8Q7TMY7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ipo8Q7TMY7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ipo8Q7TMY7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ipo8Q7TMY7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ipo8Q7TMY7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ipo8Q7TMY7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ipo8Q7TMY7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ipo8Q7TMY7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ipo8Q7TMY7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ipo8Q7TMY7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ipo8Q7TMY7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ipo8Q7TMY7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ipo8Q7TMY7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Ipo8Q7TMY7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ipo8Q7TMY7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ipo8Q7TMY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ipo8Q7TMY7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ipo8Q7TMY7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ipo8Q7TMY7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ipo8Q7TMY7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ipo8Q7TMY7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ipo8Q7TMY7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ipo8Q7TMY7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ipo8Q7TMY7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ipo8Q7TMY7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ipo8Q7TMY7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ipo8Q7TMY7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ipo8Q7TMY7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ipo8Q7TMY7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ipo8Q7TMY7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ipo8Q7TMY7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ipo8Q7TMY7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ipo8Q7TMY7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ipo8Q7TMY7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ipo8Q7TMY7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ipo8Q7TMY7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ipo8Q7TMY7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ipo8Q7TMY7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ipo8Q7TMY7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ipo8Q7TMY7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ipo8Q7TMY7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ipo8Q7TMY7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ipo8Q7TMY7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ipo8Q7TMY7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ipo8Q7TMY7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ipo8Q7TMY7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ipo8Q7TMY7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ipo8Q7TMY7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ipo8Q7TMY7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ipo8Q7TMY7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ipo8Q7TMY7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ipo8Q7TMY7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ipo8Q7TMY7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ipo8Q7TMY7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ipo8Q7TMY7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ipo8Q7TMY7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ipo8Q7TMY7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ipo8Q7TMY7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ipo8Q7TMY7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ipo8Q7TMY7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ipo8Q7TMY7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ipo8Q7TMY7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ipo8Q7TMY7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms