Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
Speer4f1Q9D5Q6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Speer4f1Q9D5Q6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Speer4f1Q9D5Q6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Speer4f1Q9D5Q6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Speer4f1Q9D5Q6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Speer4f1Q9D5Q6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Speer4f1Q9D5Q6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Speer4f1Q9D5Q6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Speer4f1Q9D5Q6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Speer4f1Q9D5Q6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Speer4f1Q9D5Q6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Speer4f1Q9D5Q6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Speer4f1Q9D5Q6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Speer4f1Q9D5Q6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Speer4f1Q9D5Q6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Speer4f1Q9D5Q6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Speer4f1Q9D5Q6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Speer4f1Q9D5Q6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Speer4f1Q9D5Q6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Speer4f1Q9D5Q6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Speer4f1Q9D5Q6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Speer4f1Q9D5Q6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Speer4f1Q9D5Q6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Speer4f1Q9D5Q6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Speer4f1Q9D5Q6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Speer4f1Q9D5Q6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Speer4f1Q9D5Q6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Speer4f1Q9D5Q6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Speer4f1Q9D5Q6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Speer4f1Q9D5Q6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Speer4f1Q9D5Q6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Speer4f1Q9D5Q6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Speer4f1Q9D5Q6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Speer4f1Q9D5Q6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Speer4f1Q9D5Q6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Speer4f1Q9D5Q6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Speer4f1Q9D5Q6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Speer4f1Q9D5Q6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Speer4f1Q9D5Q6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Speer4f1Q9D5Q6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Speer4f1Q9D5Q6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Speer4f1Q9D5Q6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Speer4f1Q9D5Q6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Speer4f1Q9D5Q6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Speer4f1Q9D5Q6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Speer4f1Q9D5Q6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Speer4f1Q9D5Q6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Speer4f1Q9D5Q6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Speer4f1Q9D5Q6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Speer4f1Q9D5Q6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Speer4f1Q9D5Q6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Speer4f1Q9D5Q6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms