Protein–RNA interactions for Protein: Q61771

Kif3b, Kinesin-like protein KIF3B, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3bQ61771 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC58.42■■■■■ 6.94
Kif3bQ61771 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
Kif3bQ61771 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
Kif3bQ61771 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
Kif3bQ61771 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
Kif3bQ61771 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.41■■■■■ 5.5
Kif3bQ61771 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
Kif3bQ61771 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Kif3bQ61771 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Kif3bQ61771 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
Kif3bQ61771 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Kif3bQ61771 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Kif3bQ61771 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Kif3bQ61771 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Kif3bQ61771 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Kif3bQ61771 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Kif3bQ61771 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Kif3bQ61771 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Kif3bQ61771 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Kif3bQ61771 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Kif3bQ61771 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Kif3bQ61771 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Kif3bQ61771 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC46.29■■■■■ 5
Kif3bQ61771 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
Kif3bQ61771 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Kif3bQ61771 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Kif3bQ61771 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Kif3bQ61771 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Kif3bQ61771 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Kif3bQ61771 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Kif3bQ61771 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Kif3bQ61771 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Kif3bQ61771 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Kif3bQ61771 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Kif3bQ61771 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
Kif3bQ61771 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Kif3bQ61771 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Kif3bQ61771 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Kif3bQ61771 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Kif3bQ61771 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
Kif3bQ61771 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Kif3bQ61771 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Kif3bQ61771 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
Kif3bQ61771 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Kif3bQ61771 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Kif3bQ61771 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Kif3bQ61771 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Kif3bQ61771 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Kif3bQ61771 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Kif3bQ61771 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Kif3bQ61771 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Kif3bQ61771 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
Kif3bQ61771 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Kif3bQ61771 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Kif3bQ61771 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Kif3bQ61771 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Kif3bQ61771 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
Kif3bQ61771 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Kif3bQ61771 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Kif3bQ61771 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Kif3bQ61771 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Kif3bQ61771 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Kif3bQ61771 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Kif3bQ61771 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Kif3bQ61771 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Kif3bQ61771 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Kif3bQ61771 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Kif3bQ61771 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Kif3bQ61771 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Kif3bQ61771 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kif3bQ61771 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kif3bQ61771 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Kif3bQ61771 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Kif3bQ61771 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kif3bQ61771 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kif3bQ61771 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Kif3bQ61771 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Kif3bQ61771 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Kif3bQ61771 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Kif3bQ61771 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Kif3bQ61771 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Kif3bQ61771 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Kif3bQ61771 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Kif3bQ61771 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Kif3bQ61771 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Kif3bQ61771 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Kif3bQ61771 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Kif3bQ61771 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Kif3bQ61771 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Kif3bQ61771 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Kif3bQ61771 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Kif3bQ61771 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Kif3bQ61771 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Kif3bQ61771 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Kif3bQ61771 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Kif3bQ61771 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Kif3bQ61771 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Kif3bQ61771 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Kif3bQ61771 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Kif3bQ61771 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms