Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66.95■■■■■ 8.31
TnnQ80Z71 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC62.26■■■■■ 7.56
TnnQ80Z71 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.89■■■■■ 7.34
TnnQ80Z71 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC58.52■■■■■ 6.96
TnnQ80Z71 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC58.13■■■■■ 6.9
TnnQ80Z71 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC57.06■■■■■ 6.72
TnnQ80Z71 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.61■■■■■ 6.65
TnnQ80Z71 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.29■■■■■ 6.6
TnnQ80Z71 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.01■■■■■ 6.56
TnnQ80Z71 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
TnnQ80Z71 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC55.75■■■■■ 6.52
TnnQ80Z71 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.69■■■■■ 6.35
TnnQ80Z71 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC54.43■■■■■ 6.3
TnnQ80Z71 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
TnnQ80Z71 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC54.04■■■■■ 6.24
TnnQ80Z71 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.22
TnnQ80Z71 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
TnnQ80Z71 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.81■■■■■ 6.2
TnnQ80Z71 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC53.41■■■■■ 6.14
TnnQ80Z71 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
TnnQ80Z71 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
TnnQ80Z71 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
TnnQ80Z71 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52.98■■■■■ 6.07
TnnQ80Z71 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC52.88■■■■■ 6.06
TnnQ80Z71 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.87■■■■■ 6.05
TnnQ80Z71 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
TnnQ80Z71 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.52■■■■■ 6
TnnQ80Z71 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
TnnQ80Z71 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
TnnQ80Z71 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
TnnQ80Z71 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.06■■■■■ 5.92
TnnQ80Z71 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
TnnQ80Z71 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
TnnQ80Z71 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.81■■■■■ 5.88
TnnQ80Z71 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
TnnQ80Z71 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.43■■■■■ 5.82
TnnQ80Z71 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC51.37■■■■■ 5.81
TnnQ80Z71 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
TnnQ80Z71 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
TnnQ80Z71 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
TnnQ80Z71 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC50.81■■■■■ 5.72
TnnQ80Z71 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
TnnQ80Z71 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50.72■■■■■ 5.71
TnnQ80Z71 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
TnnQ80Z71 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
TnnQ80Z71 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
TnnQ80Z71 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
TnnQ80Z71 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
TnnQ80Z71 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC50.26■■■■■ 5.64
TnnQ80Z71 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC50.17■■■■■ 5.62
TnnQ80Z71 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.08■■■■■ 5.61
TnnQ80Z71 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
TnnQ80Z71 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC50.04■■■■■ 5.6
TnnQ80Z71 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49.97■■■■■ 5.59
TnnQ80Z71 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC49.76■■■■■ 5.56
TnnQ80Z71 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
TnnQ80Z71 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
TnnQ80Z71 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
TnnQ80Z71 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
TnnQ80Z71 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
TnnQ80Z71 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
TnnQ80Z71 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
TnnQ80Z71 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
TnnQ80Z71 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
TnnQ80Z71 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
TnnQ80Z71 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC49.35■■■■■ 5.49
TnnQ80Z71 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.32■■■■■ 5.49
TnnQ80Z71 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC49.2■■■■■ 5.47
TnnQ80Z71 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
TnnQ80Z71 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
TnnQ80Z71 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
TnnQ80Z71 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
TnnQ80Z71 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
TnnQ80Z71 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
TnnQ80Z71 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
TnnQ80Z71 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
TnnQ80Z71 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
TnnQ80Z71 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
TnnQ80Z71 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
TnnQ80Z71 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48.69■■■■■ 5.39
TnnQ80Z71 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
TnnQ80Z71 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
TnnQ80Z71 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
TnnQ80Z71 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
TnnQ80Z71 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
TnnQ80Z71 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
TnnQ80Z71 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
TnnQ80Z71 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TnnQ80Z71 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
TnnQ80Z71 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
TnnQ80Z71 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.18■■■■■ 5.3
TnnQ80Z71 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC48.17■■■■■ 5.3
TnnQ80Z71 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
TnnQ80Z71 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
TnnQ80Z71 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
TnnQ80Z71 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
TnnQ80Z71 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
TnnQ80Z71 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
TnnQ80Z71 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
TnnQ80Z71 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327.5 ms