Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62.53■■■■■ 7.6
WrnO09053 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.89
WrnO09053 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.08■■■■■ 6.73
WrnO09053 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.54■■■■■ 6.32
WrnO09053 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.09■■■■■ 6.25
WrnO09053 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.91■■■■■ 6.06
WrnO09053 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
WrnO09053 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
WrnO09053 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
WrnO09053 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
WrnO09053 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.08■■■■■ 5.93
WrnO09053 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
WrnO09053 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.68
WrnO09053 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
WrnO09053 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
WrnO09053 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
WrnO09053 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
WrnO09053 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
WrnO09053 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
WrnO09053 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.96■■■■■ 5.59
WrnO09053 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
WrnO09053 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
WrnO09053 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
WrnO09053 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.49■■■■■ 5.51
WrnO09053 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
WrnO09053 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
WrnO09053 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
WrnO09053 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
WrnO09053 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
WrnO09053 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
WrnO09053 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
WrnO09053 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
WrnO09053 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
WrnO09053 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
WrnO09053 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.09■■■■■ 5.29
WrnO09053 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
WrnO09053 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.92■■■■■ 5.26
WrnO09053 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
WrnO09053 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.63■■■■■ 5.21
WrnO09053 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
WrnO09053 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
WrnO09053 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
WrnO09053 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
WrnO09053 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
WrnO09053 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
WrnO09053 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
WrnO09053 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
WrnO09053 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
WrnO09053 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
WrnO09053 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
WrnO09053 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
WrnO09053 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
WrnO09053 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
WrnO09053 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
WrnO09053 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
WrnO09053 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
WrnO09053 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
WrnO09053 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
WrnO09053 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
WrnO09053 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
WrnO09053 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
WrnO09053 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.32■■■■■ 5.01
WrnO09053 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
WrnO09053 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.2■■■■■ 4.99
WrnO09053 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
WrnO09053 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
WrnO09053 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
WrnO09053 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
WrnO09053 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
WrnO09053 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
WrnO09053 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
WrnO09053 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
WrnO09053 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
WrnO09053 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
WrnO09053 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
WrnO09053 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
WrnO09053 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
WrnO09053 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
WrnO09053 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
WrnO09053 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
WrnO09053 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
WrnO09053 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
WrnO09053 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
WrnO09053 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
WrnO09053 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
WrnO09053 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
WrnO09053 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
WrnO09053 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
WrnO09053 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
WrnO09053 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
WrnO09053 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
WrnO09053 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
WrnO09053 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
WrnO09053 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
WrnO09053 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
WrnO09053 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
WrnO09053 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
WrnO09053 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
WrnO09053 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
WrnO09053 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms