Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Htatsf1Q8BGC0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Htatsf1Q8BGC0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Htatsf1Q8BGC0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Htatsf1Q8BGC0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Htatsf1Q8BGC0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Htatsf1Q8BGC0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Htatsf1Q8BGC0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Htatsf1Q8BGC0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Htatsf1Q8BGC0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Htatsf1Q8BGC0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Htatsf1Q8BGC0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Htatsf1Q8BGC0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Htatsf1Q8BGC0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Htatsf1Q8BGC0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Htatsf1Q8BGC0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Htatsf1Q8BGC0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Htatsf1Q8BGC0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Htatsf1Q8BGC0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Htatsf1Q8BGC0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Htatsf1Q8BGC0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Htatsf1Q8BGC0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Htatsf1Q8BGC0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Htatsf1Q8BGC0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Htatsf1Q8BGC0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Htatsf1Q8BGC0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Htatsf1Q8BGC0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Htatsf1Q8BGC0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Htatsf1Q8BGC0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Htatsf1Q8BGC0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Htatsf1Q8BGC0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Htatsf1Q8BGC0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Htatsf1Q8BGC0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Htatsf1Q8BGC0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Htatsf1Q8BGC0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Htatsf1Q8BGC0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Htatsf1Q8BGC0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Htatsf1Q8BGC0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Htatsf1Q8BGC0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Htatsf1Q8BGC0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Htatsf1Q8BGC0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Htatsf1Q8BGC0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Htatsf1Q8BGC0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Htatsf1Q8BGC0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Htatsf1Q8BGC0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Htatsf1Q8BGC0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Htatsf1Q8BGC0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Htatsf1Q8BGC0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Htatsf1Q8BGC0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Htatsf1Q8BGC0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Htatsf1Q8BGC0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Htatsf1Q8BGC0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Htatsf1Q8BGC0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Htatsf1Q8BGC0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Htatsf1Q8BGC0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Htatsf1Q8BGC0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Htatsf1Q8BGC0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Htatsf1Q8BGC0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Htatsf1Q8BGC0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Htatsf1Q8BGC0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Htatsf1Q8BGC0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Htatsf1Q8BGC0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Htatsf1Q8BGC0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Htatsf1Q8BGC0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Htatsf1Q8BGC0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Htatsf1Q8BGC0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Htatsf1Q8BGC0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Htatsf1Q8BGC0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Htatsf1Q8BGC0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Htatsf1Q8BGC0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Htatsf1Q8BGC0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Htatsf1Q8BGC0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Htatsf1Q8BGC0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Htatsf1Q8BGC0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Htatsf1Q8BGC0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms