RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa11.11□□□□□ -0.63
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Vps13bQ80TY5 3993 aa11.08□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm20604F8WIA3 75 aa11.06□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa11.05□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Reg3aO09037 175 aa11.04□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa11.04□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Scgb1b2O35176 93 aa11.02□□□□□ -0.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm16253D3Z167 63 aa11.01□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 BikO70337 150 aa11.01□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smim20D3Z7Q2 69 aa11.01□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Spink8Q09TK9 105 aa11□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Defb12Q8K4N3 78 aa11□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnah8Q91XQ0 4731 aa11□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Krtap19-5O08632 62 aa10.99□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Spaca4Q80ZQ0 127 aa10.99□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dph3Q8K0W9 82 aa10.97□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tmem258P61166 79 aa10.97□□□□□ -0.65
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm2310J3QNJ2 377 aa10.92□□□□□ -0.66
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Samd13D3YUG0 102 aa10.91□□□□□ -0.66
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa10.91□□□□□ -0.66
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Cnn3-201ENSMUST00000029773 A0A286YE49 62 aa10.88□□□□□ -0.67
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fat3Q8BNA6 4555 aa10.84□□□□□ -0.67
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca13Q5SSE9 5034 aa10.8□□□□□ -0.68
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rps28P62858 69 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Coa6Q8BGD8 79 aa10.79□□□□□ -0.68
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Herc2Q4U2R1 4836 aa10.76□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Spint4Q9D263 159 aa10.75□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smlr1J3QMJ4 66 aa10.75□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa10.75□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SnurfQ9WU12 71 aa10.74□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rps29P62274 56 aa10.74□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa10.73□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cypt15B1AXS0 87 aa10.72□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa10.72□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atox1O08997 68 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pet100P0DJE0 76 aa10.68□□□□□ -0.7
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Birc6O88738 4882 aa10.67□□□□□ -0.7
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa10.66□□□□□ -0.7
Cnn3-201ENSMUST00000029773 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa10.66□□□□□ -0.7
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Serp1Q9Z1W5 66 aa10.63□□□□□ -0.71
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa10.61□□□□□ -0.71
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Brk1Q91VR8 75 aa10.6□□□□□ -0.71
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10267M0QWD8 85 aa10.6□□□□□ -0.71
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa10.58□□□□□ -0.72
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Coa5Q99M07 74 aa10.56□□□□□ -0.72
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chtf8P0CG14 533 aa10.54□□□□□ -0.72
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Defb13Q8R2I4 64 aa10.53□□□□□ -0.72
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa10.52□□□□□ -0.72
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa10.48□□□□□ -0.73
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm26620Q9CY65 116 aa10.46□□□□□ -0.73
Cnn3-201ENSMUST00000029773 HydinQ80W93 5154 aa10.45□□□□□ -0.74
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm11939A2A592 99 aa10.44□□□□□ -0.74
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10160F6Y577 67 aa10.41□□□□□ -0.74
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2al1aQ5M8Q2 105 aa10.38□□□□□ -0.75
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm5965D3Z724 196 aa10.34□□□□□ -0.75
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10197F6QEY5 67 aa10.34□□□□□ -0.75
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Defb38Q7TNV7 63 aa10.34□□□□□ -0.75
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SvipQ3UZP4 77 aa10.34□□□□□ -0.75
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa10.33□□□□□ -0.76
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PcloQ9QYX7 5068 aa10.29□□□□□ -0.76
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm21798J3QNU5 87 aa10.23□□□□□ -0.77
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10643Q3URG9 111 aa10.23□□□□□ -0.77
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lrp2A2ARV4 4660 aa10.22□□□□□ -0.77
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Krtap3-2Q9D638 99 aa10.19□□□□□ -0.78
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa10.19□□□□□ -0.78
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Phxr4P15974 95 aa10.19□□□□□ -0.78
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lce1mQ9CR91 182 aa10.17□□□□□ -0.78
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa10.12□□□□□ -0.79
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10999F6Q4M4 69 aa10.11□□□□□ -0.79
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm9821Q8K076 103 aa10.09□□□□□ -0.79
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm20661K7N787 53 aa10.08□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Q8BGJ3 129 aa10.06□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rpl37Q9D823 97 aa10.05□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 A930033H14RikG5E8X6 103 aa10.04□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm4491E0CX42 125 aa10.04□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2al1eQ810S6 105 aa10.03□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 2310034C09RikQ9D746 214 aa10.02□□□□□ -0.8
Cnn3-201ENSMUST00000029773 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa10.02□□□□□ -0.81
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10337F7DEP7 55 aa10□□□□□ -0.81
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Herc1E9PZP8 4859 aa9.97□□□□□ -0.81
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2al1bA0A087WP11 105 aa9.95□□□□□ -0.82
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2al1kJ3QP08 105 aa9.95□□□□□ -0.82
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2al1mQ9DAD9 105 aa9.95□□□□□ -0.82
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rnase13Q5GAM7 153 aa9.92□□□□□ -0.82
Cnn3-201ENSMUST00000029773 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa9.89□□□□□ -0.83
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ndufb1P0DN34 57 aa9.85□□□□□ -0.83
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sox16Q62247 57 aa9.84□□□□□ -0.83
Cnn3-201ENSMUST00000029773 4933415A04RikQ9D443 101 aa9.84□□□□□ -0.83
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Uqcr11Q9CPX8 56 aa9.83□□□□□ -0.84
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Limd2Q8BGB5 128 aa9.81□□□□□ -0.84
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Defb1P56386 69 aa9.78□□□□□ -0.84
Cnn3-201ENSMUST00000029773 9230102O04RikA2ASX7 82 aa9.77□□□□□ -0.85
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm18596A0A1W2P860 280 aa9.76□□□□□ -0.85
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SptssbQ925E8 76 aa9.74□□□□□ -0.85
Cnn3-201ENSMUST00000029773 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa9.71□□□□□ -0.86
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm17416Q30KP4 66 aa9.7□□□□□ -0.86
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ush2AQ2QI47 5193 aa9.57□□□□□ -0.88
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cox6b2Q80ZN9 88 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 181.2 ms