Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZU5

Krtap15-1, Keratin-associated protein 15-1, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap15-1Q9QZU5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Krtap15-1Q9QZU5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap15-1Q9QZU5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krtap15-1Q9QZU5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krtap15-1Q9QZU5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krtap15-1Q9QZU5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krtap15-1Q9QZU5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krtap15-1Q9QZU5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krtap15-1Q9QZU5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krtap15-1Q9QZU5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krtap15-1Q9QZU5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krtap15-1Q9QZU5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krtap15-1Q9QZU5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krtap15-1Q9QZU5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap15-1Q9QZU5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krtap15-1Q9QZU5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap15-1Q9QZU5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krtap15-1Q9QZU5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap15-1Q9QZU5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krtap15-1Q9QZU5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap15-1Q9QZU5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap15-1Q9QZU5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap15-1Q9QZU5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap15-1Q9QZU5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap15-1Q9QZU5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap15-1Q9QZU5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap15-1Q9QZU5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap15-1Q9QZU5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap15-1Q9QZU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap15-1Q9QZU5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap15-1Q9QZU5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap15-1Q9QZU5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap15-1Q9QZU5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krtap15-1Q9QZU5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap15-1Q9QZU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krtap15-1Q9QZU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krtap15-1Q9QZU5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krtap15-1Q9QZU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krtap15-1Q9QZU5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap15-1Q9QZU5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krtap15-1Q9QZU5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krtap15-1Q9QZU5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap15-1Q9QZU5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap15-1Q9QZU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krtap15-1Q9QZU5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap15-1Q9QZU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krtap15-1Q9QZU5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap15-1Q9QZU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap15-1Q9QZU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap15-1Q9QZU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap15-1Q9QZU5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krtap15-1Q9QZU5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap15-1Q9QZU5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap15-1Q9QZU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap15-1Q9QZU5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap15-1Q9QZU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap15-1Q9QZU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap15-1Q9QZU5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap15-1Q9QZU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap15-1Q9QZU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap15-1Q9QZU5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap15-1Q9QZU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap15-1Q9QZU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap15-1Q9QZU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap15-1Q9QZU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap15-1Q9QZU5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap15-1Q9QZU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap15-1Q9QZU5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krtap15-1Q9QZU5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krtap15-1Q9QZU5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms