Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufb1P0DN34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb1P0DN34 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb1P0DN34 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb1P0DN34 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb1P0DN34 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb1P0DN34 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb1P0DN34 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb1P0DN34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb1P0DN34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb1P0DN34 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb1P0DN34 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb1P0DN34 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb1P0DN34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb1P0DN34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb1P0DN34 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb1P0DN34 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufb1P0DN34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufb1P0DN34 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb1P0DN34 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb1P0DN34 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb1P0DN34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufb1P0DN34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndufb1P0DN34 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndufb1P0DN34 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufb1P0DN34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb1P0DN34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb1P0DN34 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb1P0DN34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb1P0DN34 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufb1P0DN34 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufb1P0DN34 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufb1P0DN34 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufb1P0DN34 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb1P0DN34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb1P0DN34 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb1P0DN34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb1P0DN34 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb1P0DN34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb1P0DN34 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb1P0DN34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb1P0DN34 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb1P0DN34 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb1P0DN34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufb1P0DN34 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb1P0DN34 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb1P0DN34 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb1P0DN34 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb1P0DN34 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb1P0DN34 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufb1P0DN34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb1P0DN34 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb1P0DN34 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb1P0DN34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb1P0DN34 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb1P0DN34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb1P0DN34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb1P0DN34 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb1P0DN34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb1P0DN34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb1P0DN34 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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