Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Defb12Q8K4N3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Defb12Q8K4N3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defb12Q8K4N3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Defb12Q8K4N3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defb12Q8K4N3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Defb12Q8K4N3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defb12Q8K4N3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Defb12Q8K4N3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defb12Q8K4N3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defb12Q8K4N3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defb12Q8K4N3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Defb12Q8K4N3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defb12Q8K4N3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defb12Q8K4N3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defb12Q8K4N3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defb12Q8K4N3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defb12Q8K4N3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Defb12Q8K4N3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defb12Q8K4N3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defb12Q8K4N3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Defb12Q8K4N3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defb12Q8K4N3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defb12Q8K4N3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defb12Q8K4N3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Defb12Q8K4N3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defb12Q8K4N3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defb12Q8K4N3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defb12Q8K4N3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defb12Q8K4N3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb12Q8K4N3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defb12Q8K4N3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb12Q8K4N3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb12Q8K4N3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defb12Q8K4N3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defb12Q8K4N3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defb12Q8K4N3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Defb12Q8K4N3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defb12Q8K4N3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defb12Q8K4N3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defb12Q8K4N3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defb12Q8K4N3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defb12Q8K4N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defb12Q8K4N3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defb12Q8K4N3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defb12Q8K4N3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defb12Q8K4N3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defb12Q8K4N3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defb12Q8K4N3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defb12Q8K4N3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defb12Q8K4N3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defb12Q8K4N3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defb12Q8K4N3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defb12Q8K4N3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defb12Q8K4N3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defb12Q8K4N3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defb12Q8K4N3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defb12Q8K4N3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defb12Q8K4N3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defb12Q8K4N3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Defb12Q8K4N3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defb12Q8K4N3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defb12Q8K4N3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defb12Q8K4N3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defb12Q8K4N3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defb12Q8K4N3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defb12Q8K4N3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defb12Q8K4N3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defb12Q8K4N3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defb12Q8K4N3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defb12Q8K4N3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defb12Q8K4N3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defb12Q8K4N3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defb12Q8K4N3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defb12Q8K4N3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defb12Q8K4N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defb12Q8K4N3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defb12Q8K4N3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defb12Q8K4N3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defb12Q8K4N3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb12Q8K4N3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defb12Q8K4N3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defb12Q8K4N3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms