Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2al1mQ9DAD9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2al1mQ9DAD9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al1mQ9DAD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al1mQ9DAD9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1mQ9DAD9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1mQ9DAD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1mQ9DAD9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al1mQ9DAD9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1mQ9DAD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1mQ9DAD9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1mQ9DAD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1mQ9DAD9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1mQ9DAD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1mQ9DAD9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1mQ9DAD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1mQ9DAD9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1mQ9DAD9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1mQ9DAD9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1mQ9DAD9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1mQ9DAD9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1mQ9DAD9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1mQ9DAD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1mQ9DAD9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1mQ9DAD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1mQ9DAD9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1mQ9DAD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1mQ9DAD9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1mQ9DAD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1mQ9DAD9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1mQ9DAD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1mQ9DAD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1mQ9DAD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1mQ9DAD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1mQ9DAD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1mQ9DAD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1mQ9DAD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1mQ9DAD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1mQ9DAD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1mQ9DAD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1mQ9DAD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1mQ9DAD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1mQ9DAD9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1mQ9DAD9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1mQ9DAD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1mQ9DAD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1mQ9DAD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1mQ9DAD9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1mQ9DAD9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1mQ9DAD9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1mQ9DAD9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1mQ9DAD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1mQ9DAD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1mQ9DAD9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1mQ9DAD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1mQ9DAD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1mQ9DAD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1mQ9DAD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1mQ9DAD9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1mQ9DAD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1mQ9DAD9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1mQ9DAD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1mQ9DAD9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1mQ9DAD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1mQ9DAD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1mQ9DAD9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms