Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A530084C06RikQ3UTW2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A530084C06RikQ3UTW2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A530084C06RikQ3UTW2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A530084C06RikQ3UTW2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A530084C06RikQ3UTW2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
A530084C06RikQ3UTW2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
A530084C06RikQ3UTW2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A530084C06RikQ3UTW2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A530084C06RikQ3UTW2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A530084C06RikQ3UTW2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A530084C06RikQ3UTW2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A530084C06RikQ3UTW2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A530084C06RikQ3UTW2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A530084C06RikQ3UTW2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A530084C06RikQ3UTW2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
A530084C06RikQ3UTW2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
A530084C06RikQ3UTW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A530084C06RikQ3UTW2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A530084C06RikQ3UTW2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A530084C06RikQ3UTW2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A530084C06RikQ3UTW2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A530084C06RikQ3UTW2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A530084C06RikQ3UTW2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A530084C06RikQ3UTW2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A530084C06RikQ3UTW2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A530084C06RikQ3UTW2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A530084C06RikQ3UTW2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A530084C06RikQ3UTW2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A530084C06RikQ3UTW2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
A530084C06RikQ3UTW2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A530084C06RikQ3UTW2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
A530084C06RikQ3UTW2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A530084C06RikQ3UTW2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A530084C06RikQ3UTW2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A530084C06RikQ3UTW2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
A530084C06RikQ3UTW2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A530084C06RikQ3UTW2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A530084C06RikQ3UTW2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms