Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim20D3Z7Q2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim20D3Z7Q2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim20D3Z7Q2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim20D3Z7Q2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim20D3Z7Q2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim20D3Z7Q2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim20D3Z7Q2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim20D3Z7Q2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim20D3Z7Q2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim20D3Z7Q2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim20D3Z7Q2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim20D3Z7Q2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim20D3Z7Q2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim20D3Z7Q2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim20D3Z7Q2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim20D3Z7Q2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim20D3Z7Q2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim20D3Z7Q2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim20D3Z7Q2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim20D3Z7Q2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim20D3Z7Q2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim20D3Z7Q2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim20D3Z7Q2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim20D3Z7Q2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim20D3Z7Q2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim20D3Z7Q2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim20D3Z7Q2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim20D3Z7Q2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim20D3Z7Q2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim20D3Z7Q2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim20D3Z7Q2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim20D3Z7Q2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim20D3Z7Q2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim20D3Z7Q2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim20D3Z7Q2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim20D3Z7Q2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim20D3Z7Q2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim20D3Z7Q2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim20D3Z7Q2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim20D3Z7Q2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim20D3Z7Q2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim20D3Z7Q2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim20D3Z7Q2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim20D3Z7Q2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim20D3Z7Q2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim20D3Z7Q2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim20D3Z7Q2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim20D3Z7Q2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim20D3Z7Q2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim20D3Z7Q2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim20D3Z7Q2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim20D3Z7Q2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim20D3Z7Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim20D3Z7Q2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim20D3Z7Q2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim20D3Z7Q2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim20D3Z7Q2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim20D3Z7Q2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim20D3Z7Q2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim20D3Z7Q2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim20D3Z7Q2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim20D3Z7Q2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim20D3Z7Q2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim20D3Z7Q2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim20D3Z7Q2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim20D3Z7Q2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim20D3Z7Q2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim20D3Z7Q2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim20D3Z7Q2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim20D3Z7Q2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.5 ms