Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb1P56386 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defb1P56386 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defb1P56386 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defb1P56386 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defb1P56386 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defb1P56386 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defb1P56386 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defb1P56386 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defb1P56386 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Defb1P56386 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defb1P56386 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defb1P56386 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb1P56386 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb1P56386 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb1P56386 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb1P56386 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb1P56386 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb1P56386 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb1P56386 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb1P56386 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb1P56386 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb1P56386 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb1P56386 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb1P56386 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb1P56386 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb1P56386 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defb1P56386 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb1P56386 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb1P56386 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb1P56386 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb1P56386 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb1P56386 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb1P56386 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defb1P56386 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defb1P56386 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb1P56386 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb1P56386 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb1P56386 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb1P56386 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb1P56386 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb1P56386 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb1P56386 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb1P56386 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb1P56386 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb1P56386 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb1P56386 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb1P56386 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb1P56386 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb1P56386 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb1P56386 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb1P56386 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb1P56386 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb1P56386 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb1P56386 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb1P56386 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb1P56386 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb1P56386 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defb1P56386 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defb1P56386 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb1P56386 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb1P56386 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defb1P56386 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb1P56386 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb1P56386 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb1P56386 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb1P56386 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb1P56386 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defb1P56386 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defb1P56386 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defb1P56386 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defb1P56386 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defb1P56386 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defb1P56386 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defb1P56386 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defb1P56386 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defb1P56386 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defb1P56386 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defb1P56386 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defb1P56386 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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