Protein–RNA interactions for Protein: D3YUG0

Samd13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd13D3YUG0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd13D3YUG0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd13D3YUG0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd13D3YUG0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd13D3YUG0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd13D3YUG0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd13D3YUG0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd13D3YUG0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd13D3YUG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd13D3YUG0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd13D3YUG0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd13D3YUG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd13D3YUG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd13D3YUG0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd13D3YUG0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd13D3YUG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd13D3YUG0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd13D3YUG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd13D3YUG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd13D3YUG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd13D3YUG0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd13D3YUG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samd13D3YUG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd13D3YUG0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd13D3YUG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd13D3YUG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd13D3YUG0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd13D3YUG0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd13D3YUG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd13D3YUG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd13D3YUG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd13D3YUG0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd13D3YUG0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd13D3YUG0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd13D3YUG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd13D3YUG0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd13D3YUG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd13D3YUG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd13D3YUG0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd13D3YUG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd13D3YUG0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd13D3YUG0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd13D3YUG0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd13D3YUG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd13D3YUG0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd13D3YUG0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd13D3YUG0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd13D3YUG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd13D3YUG0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd13D3YUG0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd13D3YUG0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd13D3YUG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd13D3YUG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd13D3YUG0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd13D3YUG0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd13D3YUG0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd13D3YUG0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd13D3YUG0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd13D3YUG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd13D3YUG0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd13D3YUG0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd13D3YUG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd13D3YUG0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd13D3YUG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd13D3YUG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd13D3YUG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd13D3YUG0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd13D3YUG0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd13D3YUG0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms