Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21798J3QNU5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21798J3QNU5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21798J3QNU5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21798J3QNU5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21798J3QNU5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21798J3QNU5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21798J3QNU5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21798J3QNU5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21798J3QNU5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21798J3QNU5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21798J3QNU5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21798J3QNU5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21798J3QNU5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21798J3QNU5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21798J3QNU5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21798J3QNU5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21798J3QNU5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21798J3QNU5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21798J3QNU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21798J3QNU5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21798J3QNU5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21798J3QNU5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21798J3QNU5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21798J3QNU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21798J3QNU5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21798J3QNU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21798J3QNU5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21798J3QNU5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21798J3QNU5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21798J3QNU5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21798J3QNU5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21798J3QNU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21798J3QNU5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21798J3QNU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21798J3QNU5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21798J3QNU5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21798J3QNU5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21798J3QNU5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21798J3QNU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21798J3QNU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21798J3QNU5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21798J3QNU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21798J3QNU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21798J3QNU5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21798J3QNU5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21798J3QNU5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21798J3QNU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21798J3QNU5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21798J3QNU5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21798J3QNU5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21798J3QNU5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21798J3QNU5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21798J3QNU5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21798J3QNU5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21798J3QNU5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21798J3QNU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21798J3QNU5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21798J3QNU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21798J3QNU5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21798J3QNU5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21798J3QNU5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21798J3QNU5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21798J3QNU5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21798J3QNU5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21798J3QNU5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21798J3QNU5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21798J3QNU5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21798J3QNU5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21798J3QNU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21798J3QNU5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21798J3QNU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21798J3QNU5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21798J3QNU5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21798J3QNU5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21798J3QNU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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