Protein–RNA interactions for Protein: F6Q4M4

Gm10999, Predicted gene 10999, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10999F6Q4M4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm10999F6Q4M4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10999F6Q4M4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10999F6Q4M4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm10999F6Q4M4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm10999F6Q4M4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10999F6Q4M4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm10999F6Q4M4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10999F6Q4M4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm10999F6Q4M4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm10999F6Q4M4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm10999F6Q4M4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10999F6Q4M4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm10999F6Q4M4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10999F6Q4M4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10999F6Q4M4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10999F6Q4M4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10999F6Q4M4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm10999F6Q4M4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm10999F6Q4M4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm10999F6Q4M4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10999F6Q4M4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10999F6Q4M4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10999F6Q4M4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10999F6Q4M4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10999F6Q4M4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10999F6Q4M4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10999F6Q4M4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10999F6Q4M4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10999F6Q4M4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10999F6Q4M4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10999F6Q4M4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10999F6Q4M4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10999F6Q4M4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10999F6Q4M4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10999F6Q4M4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10999F6Q4M4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10999F6Q4M4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10999F6Q4M4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10999F6Q4M4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10999F6Q4M4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10999F6Q4M4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10999F6Q4M4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10999F6Q4M4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10999F6Q4M4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10999F6Q4M4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10999F6Q4M4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10999F6Q4M4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10999F6Q4M4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10999F6Q4M4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10999F6Q4M4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10999F6Q4M4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10999F6Q4M4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10999F6Q4M4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10999F6Q4M4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10999F6Q4M4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10999F6Q4M4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10999F6Q4M4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10999F6Q4M4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10999F6Q4M4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10999F6Q4M4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10999F6Q4M4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10999F6Q4M4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10999F6Q4M4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10999F6Q4M4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10999F6Q4M4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10999F6Q4M4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10999F6Q4M4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10999F6Q4M4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10999F6Q4M4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10999F6Q4M4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10999F6Q4M4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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