Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm4491E0CX42 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4491E0CX42 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4491E0CX42 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm4491E0CX42 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm4491E0CX42 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm4491E0CX42 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4491E0CX42 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm4491E0CX42 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm4491E0CX42 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4491E0CX42 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4491E0CX42 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm4491E0CX42 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4491E0CX42 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4491E0CX42 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm4491E0CX42 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4491E0CX42 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4491E0CX42 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4491E0CX42 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm4491E0CX42 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4491E0CX42 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4491E0CX42 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4491E0CX42 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4491E0CX42 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4491E0CX42 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4491E0CX42 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4491E0CX42 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4491E0CX42 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4491E0CX42 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4491E0CX42 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4491E0CX42 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm4491E0CX42 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4491E0CX42 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4491E0CX42 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4491E0CX42 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4491E0CX42 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm4491E0CX42 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4491E0CX42 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4491E0CX42 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4491E0CX42 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4491E0CX42 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4491E0CX42 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4491E0CX42 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4491E0CX42 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4491E0CX42 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4491E0CX42 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4491E0CX42 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4491E0CX42 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4491E0CX42 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4491E0CX42 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4491E0CX42 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm4491E0CX42 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4491E0CX42 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4491E0CX42 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4491E0CX42 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4491E0CX42 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4491E0CX42 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4491E0CX42 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm4491E0CX42 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4491E0CX42 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4491E0CX42 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm4491E0CX42 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm4491E0CX42 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4491E0CX42 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4491E0CX42 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm4491E0CX42 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm4491E0CX42 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm4491E0CX42 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm4491E0CX42 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm4491E0CX42 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4491E0CX42 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4491E0CX42 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4491E0CX42 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4491E0CX42 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4491E0CX42 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4491E0CX42 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4491E0CX42 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm4491E0CX42 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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