RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583524.5

PHF12-212, Transcript of PHD finger protein 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHF12, Length 1,875 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12-212ENST00000583524 APLP2Q06481 763 aa42.57■■■■■ 4.41
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PHF12-212ENST00000583524 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
PHF12-212ENST00000583524 HRCP23327 699 aa42.37■■■■■ 4.37
PHF12-212ENST00000583524 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.31■■■■■ 4.36
PHF12-212ENST00000583524 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PHF12-212ENST00000583524 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PHF12-212ENST00000583524 SAMD9Q5K651 1589 aa42.27■■■■■ 4.36
PHF12-212ENST00000583524 MAP3K1Q13233 1512 aa42.26■■■■■ 4.36
PHF12-212ENST00000583524 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.2■■■■■ 4.35
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PHF12-212ENST00000583524 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.63■■■■■ 4.26
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PHF12-212ENST00000583524 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
PHF12-212ENST00000583524 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
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PHF12-212ENST00000583524 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.94■■■■■ 4.14
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PHF12-212ENST00000583524 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.9■■■■■ 4.14
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PHF12-212ENST00000583524 OSCARQ8IYS5 282 aa40.47■■■■■ 4.07
PHF12-212ENST00000583524 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.46■■■■■ 4.07
PHF12-212ENST00000583524 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.45■■■■■ 4.07
PHF12-212ENST00000583524 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.44■■■■■ 4.07
PHF12-212ENST00000583524 ROCK1Q13464 1354 aa40.43■■■■■ 4.06
PHF12-212ENST00000583524 ABCC5O15440 1437 aa40.42■■■■■ 4.06
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