RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583524.5

PHF12-212, Transcript of PHD finger protein 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHF12, Length 1,875 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12-212ENST00000583524 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.57■■■■■ 7.45
PHF12-212ENST00000583524 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.56■■■■■ 6.16
PHF12-212ENST00000583524 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
PHF12-212ENST00000583524 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51■■■■■ 5.76
PHF12-212ENST00000583524 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.6■■■■■ 5.69
PHF12-212ENST00000583524 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.31■■■■■ 5.64
PHF12-212ENST00000583524 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.29■■■■■ 5.64
PHF12-212ENST00000583524 ABCC9O60706 1549 aa50.22■■■■■ 5.63
PHF12-212ENST00000583524 NACADO15069 1562 aa49.82■■■■■ 5.57
PHF12-212ENST00000583524 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.28■■■■■ 5.48
PHF12-212ENST00000583524 SCRIBQ14160 1630 aa49.19■■■■■ 5.47
PHF12-212ENST00000583524 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
PHF12-212ENST00000583524 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.22■■■■■ 5.31
PHF12-212ENST00000583524 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.88■■■■■ 5.26
PHF12-212ENST00000583524 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.74■■■■■ 5.23
PHF12-212ENST00000583524 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.74■■■■■ 5.23
PHF12-212ENST00000583524 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.53■■■■■ 5.2
PHF12-212ENST00000583524 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
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PHF12-212ENST00000583524 SMARCA4P51532 1647 aa47.24■■■■■ 5.15
PHF12-212ENST00000583524 WIZO95785 1651 aa47.14■■■■■ 5.14
PHF12-212ENST00000583524 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.8■■■■■ 5.08
PHF12-212ENST00000583524 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
PHF12-212ENST00000583524 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.71■■■■■ 5.07
PHF12-212ENST00000583524 SMARCA2P51531 1590 aa46.41■■■■■ 5.02
PHF12-212ENST00000583524 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.39■■■■■ 5.02
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PHF12-212ENST00000583524 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.24■■■■■ 4.99
PHF12-212ENST00000583524 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
PHF12-212ENST00000583524 NCAPD3P42695 1498 aa45.97■■■■■ 4.95
PHF12-212ENST00000583524 HMGXB3Q12766 1538 aa45.94■■■■■ 4.95
PHF12-212ENST00000583524 TRIM41Q8WV44 630 aa45.76■■■■■ 4.92
PHF12-212ENST00000583524 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.49■■■■■ 4.87
PHF12-212ENST00000583524 ABCC8Q09428 1581 aa45.3■■■■■ 4.84
PHF12-212ENST00000583524 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.07■■■■■ 4.8
PHF12-212ENST00000583524 CFTRP13569 1480 aa45.04■■■■■ 4.8
PHF12-212ENST00000583524 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.93■■■■■ 4.78
PHF12-212ENST00000583524 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
PHF12-212ENST00000583524 SYNJ1O43426 1573 aa44.82■■■■■ 4.77
PHF12-212ENST00000583524 PRDM2Q13029 1718 aa44.81■■■■■ 4.76
PHF12-212ENST00000583524 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.8■■■■■ 4.76
PHF12-212ENST00000583524 EEA1Q15075 1411 aa44.69■■■■■ 4.75
PHF12-212ENST00000583524 TOP2BQ02880 1626 aa44.67■■■■■ 4.74
PHF12-212ENST00000583524 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.62■■■■■ 4.73
PHF12-212ENST00000583524 SOGA1O94964 1423 aa44.56■■■■■ 4.72
PHF12-212ENST00000583524 CUX1P39880 1505 aa44.43■■■■■ 4.7
PHF12-212ENST00000583524 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.34■■■■■ 4.69
PHF12-212ENST00000583524 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.34■■■■■ 4.69
PHF12-212ENST00000583524 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.34■■■■■ 4.69
PHF12-212ENST00000583524 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.28■■■■■ 4.68
PHF12-212ENST00000583524 NESP48681 1621 aa44.19■■■■■ 4.66
PHF12-212ENST00000583524 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.12■■■■■ 4.65
PHF12-212ENST00000583524 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.09■■■■■ 4.65
PHF12-212ENST00000583524 KIF21BO75037 1637 aa44.04■■■■■ 4.64
PHF12-212ENST00000583524 GOLGA3Q08378 1498 aa44.03■■■■■ 4.64
PHF12-212ENST00000583524 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.01■■■■■ 4.64
PHF12-212ENST00000583524 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.99■■■■■ 4.63
PHF12-212ENST00000583524 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.97■■■■■ 4.63
PHF12-212ENST00000583524 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.97■■■■■ 4.63
PHF12-212ENST00000583524 KIF27Q86VH2 1401 aa43.93■■■■■ 4.62
PHF12-212ENST00000583524 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
PHF12-212ENST00000583524 TOPBP1Q92547 1522 aa43.84■■■■■ 4.61
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PHF12-212ENST00000583524 PRXQ9BXM0 1461 aa43.71■■■■■ 4.59
PHF12-212ENST00000583524 CEP162Q5TB80 1403 aa43.71■■■■■ 4.59
PHF12-212ENST00000583524 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.7■■■■■ 4.59
PHF12-212ENST00000583524 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
PHF12-212ENST00000583524 CUX2O14529 1486 aa43.68■■■■■ 4.58
PHF12-212ENST00000583524 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.68■■■■■ 4.58
PHF12-212ENST00000583524 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.66■■■■■ 4.58
PHF12-212ENST00000583524 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
PHF12-212ENST00000583524 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.57■■■■■ 4.57
PHF12-212ENST00000583524 IGF1RP08069 1367 aa43.48■■■■■ 4.55
PHF12-212ENST00000583524 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.46■■■■■ 4.55
PHF12-212ENST00000583524 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.39■■■■■ 4.54
PHF12-212ENST00000583524 WDR97A6NE52 1622 aa43.36■■■■■ 4.53
PHF12-212ENST00000583524 CLIP1P30622 1438 aa43.31■■■■■ 4.52
PHF12-212ENST00000583524 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
PHF12-212ENST00000583524 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.26■■■■■ 4.52
PHF12-212ENST00000583524 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.26■■■■■ 4.52
PHF12-212ENST00000583524 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.16■■■■■ 4.5
PHF12-212ENST00000583524 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
PHF12-212ENST00000583524 WDR62O43379 1518 aa43.15■■■■■ 4.5
PHF12-212ENST00000583524 CUL7Q14999 1698 aa43.14■■■■■ 4.5
PHF12-212ENST00000583524 ERCC6Q03468 1493 aa43.07■■■■■ 4.48
PHF12-212ENST00000583524 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.05■■■■■ 4.48
PHF12-212ENST00000583524 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
PHF12-212ENST00000583524 VPS8Q8N3P4 1428 aa43■■■■■ 4.47
PHF12-212ENST00000583524 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.46
PHF12-212ENST00000583524 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
PHF12-212ENST00000583524 ARAP1Q96P48 1450 aa42.82■■■■■ 4.45
PHF12-212ENST00000583524 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
PHF12-212ENST00000583524 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.76■■■■■ 4.44
PHF12-212ENST00000583524 PBRM1Q86U86 1689 aa42.75■■■■■ 4.43
PHF12-212ENST00000583524 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
PHF12-212ENST00000583524 GRIN2BQ13224 1484 aa42.69■■■■■ 4.42
PHF12-212ENST00000583524 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.422e-6■■■■□ 22
PHF12-212ENST00000583524 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.67■■■■■ 4.42
PHF12-212ENST00000583524 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.63■■■■■ 4.41
PHF12-212ENST00000583524 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
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