RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568206.1

HERC2-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene HERC2, Length 2,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-210ENST00000568206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
HERC2-210ENST00000568206 ADAMTS12P58397 1594 aa29.87■■■□□ 2.37
HERC2-210ENST00000568206 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.84■■■□□ 2.37
HERC2-210ENST00000568206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
HERC2-210ENST00000568206 HRCP23327 699 aa29.73■■■□□ 2.35
HERC2-210ENST00000568206 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
HERC2-210ENST00000568206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.71■■■□□ 2.35
HERC2-210ENST00000568206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
HERC2-210ENST00000568206 SAMD9Q5K651 1589 aa29.65■■■□□ 2.34
HERC2-210ENST00000568206 MAP3K1Q13233 1512 aa29.62■■■□□ 2.33
HERC2-210ENST00000568206 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.62■■■□□ 2.33
HERC2-210ENST00000568206 IQGAP2Q13576 1575 aa29.6■■■□□ 2.33
HERC2-210ENST00000568206 GRIN2AQ12879 1464 aa29.58■■■□□ 2.33
HERC2-210ENST00000568206 P3H3Q8IVL6 736 aa29.57■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 FMN1Q68DA7 1419 aa29.57■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 SYNJ2O15056 1496 aa29.56■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 TIAM1Q13009 1591 aa29.52■■■□□ 2.32
HERC2-210ENST00000568206 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.51■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.51■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.47■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.45■■■□□ 2.31
HERC2-210ENST00000568206 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.38■■■□□ 2.29
HERC2-210ENST00000568206 CEP170Q5SW79 1584 aa29.36■■■□□ 2.29
HERC2-210ENST00000568206 NUP160Q12769 1436 aa29.35■■■□□ 2.29
HERC2-210ENST00000568206 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
HERC2-210ENST00000568206 FBLN2P98095 1184 aa29.32■■■□□ 2.28
HERC2-210ENST00000568206 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HERC2-210ENST00000568206 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HERC2-210ENST00000568206 KIAA0556O60303 1618 aa29.29■■■□□ 2.28
HERC2-210ENST00000568206 DISP1Q96F81 1524 aa29.27■■■□□ 2.28
HERC2-210ENST00000568206 HECW1Q76N89 1606 aa29.23■■■□□ 2.27
HERC2-210ENST00000568206 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.21■■■□□ 2.27
HERC2-210ENST00000568206 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.18■■■□□ 2.26
HERC2-210ENST00000568206 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.18■■■□□ 2.26
HERC2-210ENST00000568206 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
HERC2-210ENST00000568206 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.15■■■□□ 2.26
HERC2-210ENST00000568206 JPH4Q96JJ6 628 aa29.13■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.13■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 CHD1O14646 1710 aa29.12■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.1■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.09■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HERC2-210ENST00000568206 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.04■■■□□ 2.24
HERC2-210ENST00000568206 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HERC2-210ENST00000568206 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
HERC2-210ENST00000568206 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HERC2-210ENST00000568206 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HERC2-210ENST00000568206 NCOA2Q15596 1464 aa28.95■■■□□ 2.23
HERC2-210ENST00000568206 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.95■■■□□ 2.22
HERC2-210ENST00000568206 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
HERC2-210ENST00000568206 ARHGEF11O15085 1522 aa28.92■■■□□ 2.22
HERC2-210ENST00000568206 SHROOM2Q13796 1616 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC2-210ENST00000568206 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC2-210ENST00000568206 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.88■■■□□ 2.21
HERC2-210ENST00000568206 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.88■■■□□ 2.21
HERC2-210ENST00000568206 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HERC2-210ENST00000568206 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
HERC2-210ENST00000568206 ABCA8O94911 1581 aa28.84■■■□□ 2.21
HERC2-210ENST00000568206 ITGAEP38570 1179 aa28.81■■■□□ 2.2
HERC2-210ENST00000568206 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.81■■■□□ 2.2
HERC2-210ENST00000568206 ARID3CA6NKF2 412 aa28.79■■■□□ 2.2
HERC2-210ENST00000568206 PTPRGP23470 1445 aa28.79■■■□□ 2.2
HERC2-210ENST00000568206 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.73■■■□□ 2.19
HERC2-210ENST00000568206 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
HERC2-210ENST00000568206 MIA2Q96PC5 1412 aa28.73■■■□□ 2.19
HERC2-210ENST00000568206 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
HERC2-210ENST00000568206 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.68■■■□□ 2.18
HERC2-210ENST00000568206 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.68■■■□□ 2.18
HERC2-210ENST00000568206 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.66■■■□□ 2.18
HERC2-210ENST00000568206 ATP10BO94823 1461 aa28.66■■■□□ 2.18
HERC2-210ENST00000568206 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
HERC2-210ENST00000568206 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.64■■■□□ 2.17
HERC2-210ENST00000568206 UACAQ9BZF9 1416 aa28.64■■■□□ 2.17
HERC2-210ENST00000568206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.62■■■□□ 2.17
HERC2-210ENST00000568206 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.59■■■□□ 2.17
HERC2-210ENST00000568206 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.57■■■□□ 2.16
HERC2-210ENST00000568206 ABCC2Q92887 1545 aa28.55■■■□□ 2.16
HERC2-210ENST00000568206 KIF14Q15058 1648 aa28.54■■■□□ 2.16
HERC2-210ENST00000568206 PTPRKQ15262 1439 aa28.53■■■□□ 2.16
HERC2-210ENST00000568206 HFM1A2PYH4 1435 aa28.52■■■□□ 2.16
HERC2-210ENST00000568206 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HERC2-210ENST00000568206 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.47■■■□□ 2.15
HERC2-210ENST00000568206 AKNAQ7Z591 1439 aa28.46■■■□□ 2.15
HERC2-210ENST00000568206 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.44■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 NAIPQ13075 1403 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 OSCARQ8IYS5 282 aa28.41■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 DAPK1P53355 1430 aa28.39■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.39■■■□□ 2.14
HERC2-210ENST00000568206 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.38■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.38■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.35■■■□□ 2.13
HERC2-210ENST00000568206 ROCK1Q13464 1354 aa28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms