RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-229ENST00000515802 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-229ENST00000515802 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.27
SH3BP2-229ENST00000515802 IFT140Q96RY7 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 ERCC6Q03468 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 TIAM1Q13009 1591 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 ADAMTS12P58397 1594 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 MAP3K1Q13233 1512 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-229ENST00000515802 P3H3Q8IVL6 736 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-229ENST00000515802 SAMD9Q5K651 1589 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-229ENST00000515802 GRIN2BQ13224 1484 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-229ENST00000515802 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-229ENST00000515802 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-229ENST00000515802 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-229ENST00000515802 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-229ENST00000515802 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-229ENST00000515802 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-229ENST00000515802 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-229ENST00000515802 FMN1Q68DA7 1419 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-229ENST00000515802 IQGAP2Q13576 1575 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-229ENST00000515802 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-229ENST00000515802 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-229ENST00000515802 GRIN2AQ12879 1464 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-229ENST00000515802 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-229ENST00000515802 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-229ENST00000515802 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-229ENST00000515802 SYNJ2O15056 1496 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-229ENST00000515802 CEP170Q5SW79 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-229ENST00000515802 KIAA0556O60303 1618 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-229ENST00000515802 HECW1Q76N89 1606 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-229ENST00000515802 DISP1Q96F81 1524 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 ITGAEP38570 1179 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-229ENST00000515802 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 NUP160Q12769 1436 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 NCOA2Q15596 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.183e-7■□□□□ 10
SH3BP2-229ENST00000515802 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF11O15085 1522 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-229ENST00000515802 FBLN2P98095 1184 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-229ENST00000515802 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-229ENST00000515802 ARID3CA6NKF2 412 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-229ENST00000515802 CHD1O14646 1710 aa22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 JPH4Q96JJ6 628 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPRKQ15262 1439 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 MAPKBP1O60336 1514 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-229ENST00000515802 HFM1A2PYH4 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-229ENST00000515802 MIA2Q96PC5 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCA8O94911 1581 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 NAIPQ13075 1403 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 SHROOM2Q13796 1616 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF14Q15058 1648 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-229ENST00000515802 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-229ENST00000515802 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP10BO94823 1461 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 AKNAQ7Z591 1439 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 UACAQ9BZF9 1416 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPRGP23470 1445 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 DAPK1P53355 1430 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 KDM6BO15054 1643 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-229ENST00000515802 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-229ENST00000515802 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.95■■□□□ 1.1
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