RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.21■■■□□ 2.91
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-229ENST00000515802 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-229ENST00000515802 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP2-229ENST00000515802 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-229ENST00000515802 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC9O60706 1549 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-229ENST00000515802 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-229ENST00000515802 NACADO15069 1562 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-229ENST00000515802 SCRIBQ14160 1630 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-229ENST00000515802 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-229ENST00000515802 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-229ENST00000515802 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-229ENST00000515802 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-229ENST00000515802 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-229ENST00000515802 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-229ENST00000515802 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-229ENST00000515802 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-229ENST00000515802 WIZO95785 1651 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-229ENST00000515802 SMARCA4P51532 1647 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-229ENST00000515802 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.661e-6■■□□□ 13.4
SH3BP2-229ENST00000515802 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-229ENST00000515802 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-229ENST00000515802 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-229ENST00000515802 SMARCA2P51531 1590 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM41Q8WV44 630 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-229ENST00000515802 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-229ENST00000515802 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-229ENST00000515802 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC8Q09428 1581 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-229ENST00000515802 HMGXB3Q12766 1538 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-229ENST00000515802 NCAPD3P42695 1498 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-229ENST00000515802 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-229ENST00000515802 SYNJ1O43426 1573 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-229ENST00000515802 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-229ENST00000515802 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-229ENST00000515802 SOGA1O94964 1423 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-229ENST00000515802 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.2■■□□□ 1.47
SH3BP2-229ENST00000515802 EEA1Q15075 1411 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-229ENST00000515802 CFTRP13569 1480 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-229ENST00000515802 TOP2BQ02880 1626 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-229ENST00000515802 PRDM2Q13029 1718 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-229ENST00000515802 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-229ENST00000515802 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-229ENST00000515802 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-229ENST00000515802 CUX1P39880 1505 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-229ENST00000515802 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF21BO75037 1637 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA3Q08378 1498 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-229ENST00000515802 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-229ENST00000515802 CEP162Q5TB80 1403 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-229ENST00000515802 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-229ENST00000515802 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-229ENST00000515802 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-229ENST00000515802 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-229ENST00000515802 NESP48681 1621 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-229ENST00000515802 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-229ENST00000515802 HRCP23327 699 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF27Q86VH2 1401 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 PRXQ9BXM0 1461 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-229ENST00000515802 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-229ENST00000515802 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-229ENST00000515802 CLIP1P30622 1438 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-229ENST00000515802 CUX2O14529 1486 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-229ENST00000515802 TOPBP1Q92547 1522 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-229ENST00000515802 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-229ENST00000515802 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-229ENST00000515802 IGF1RP08069 1367 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-229ENST00000515802 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-229ENST00000515802 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-229ENST00000515802 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-229ENST00000515802 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-229ENST00000515802 WDR97A6NE52 1622 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-229ENST00000515802 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-229ENST00000515802 ARAP1Q96P48 1450 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-229ENST00000515802 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-229ENST00000515802 MYT1Q01538 1121 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-229ENST00000515802 CUL7Q14999 1698 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-229ENST00000515802 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-229ENST00000515802 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-229ENST00000515802 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-229ENST00000515802 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2-229ENST00000515802 APLP2Q06481 763 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-229ENST00000515802 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-229ENST00000515802 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-229ENST00000515802 WDR62O43379 1518 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-229ENST00000515802 PBRM1Q86U86 1689 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-229ENST00000515802 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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