RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIN2BQ13224 1484 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR97A6NE52 1622 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNJ2O15056 1496 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 CUL7Q14999 1698 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 PBRM1Q86U86 1689 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP2-209ENST00000504450 APLP2Q06481 763 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIN2AQ12879 1464 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP3K1Q13233 1512 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS12P58397 1594 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP170Q5SW79 1584 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP160Q12769 1436 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD9Q5K651 1589 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TIAM1Q13009 1591 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 P3H3Q8IVL6 736 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 FMN1Q68DA7 1419 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SHROOM2Q13796 1616 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 JPH4Q96JJ6 628 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP2-209ENST00000504450 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IQGAP2Q13576 1575 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP2-209ENST00000504450 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP2-209ENST00000504450 DISP1Q96F81 1524 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-209ENST00000504450 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 10
SH3BP2-209ENST00000504450 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA0556O60303 1618 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPKBP1O60336 1514 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 DIP2BQ9P265 1576 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 HECW1Q76N89 1606 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRGP23470 1445 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-209ENST00000504450 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 NCOA2Q15596 1464 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM6BO15054 1643 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPOAP1O95153 1857 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGAEP38570 1179 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC2Q92887 1545 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 ASXL2Q76L83 1435 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRKQ15262 1439 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-209ENST00000504450 MIA2Q96PC5 1412 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 UACAQ9BZF9 1416 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA8O94911 1581 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 ARID3CA6NKF2 412 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP2-209ENST00000504450 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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