RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.89■■□□□ 1.42
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SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.77■□□□□ 0.76
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SH3BP2-209ENST00000504450 SCRIBQ14160 1630 aa19.07■□□□□ 0.64
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SH3BP2-209ENST00000504450 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP2-209ENST00000504450 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.45■□□□□ 0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP2-209ENST00000504450 ERCC6Q03468 1493 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP2-209ENST00000504450 SMARCA2P51531 1590 aa18.08■□□□□ 0.49
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SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM41Q8WV44 630 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2-209ENST00000504450 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-209ENST00000504450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-209ENST00000504450 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC8Q09428 1581 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-209ENST00000504450 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP2-209ENST00000504450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-209ENST00000504450 CFTRP13569 1480 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNJ1O43426 1573 aa17.42■□□□□ 0.38
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SH3BP2-209ENST00000504450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-209ENST00000504450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.3■□□□□ 0.36
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SH3BP2-209ENST00000504450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM2Q13029 1718 aa17.23■□□□□ 0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 IFT140Q96RY7 1462 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF21BO75037 1637 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 TOPBP1Q92547 1522 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP162Q5TB80 1403 aa17.1■□□□□ 0.33
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SH3BP2-209ENST00000504450 KIF27Q86VH2 1401 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF11O15085 1522 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17■□□□□ 0.31
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SH3BP2-209ENST00000504450 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 CHD1O14646 1710 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 IGF1RP08069 1367 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 HRCP23327 699 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 CLIP1P30622 1438 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP2-209ENST00000504450 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.86■□□□□ 0.29
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