RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRIN2BQ13224 1484 aa26.77■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTS12P58397 1594 aa26.74■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.74■■□□□ 1.87
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAP3K1Q13233 1512 aa26.6■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAMD9Q5K651 1589 aa26.59■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.56■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIAM1Q13009 1591 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IQGAP2Q13576 1575 aa26.52■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FMN1Q68DA7 1419 aa26.52■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.51■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 P3H3Q8IVL6 736 aa26.51■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.5■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRIN2AQ12879 1464 aa26.44■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNJ2O15056 1496 aa26.4■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.39■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.38■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.37■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP170Q5SW79 1584 aa26.25■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIAA0556O60303 1618 aa26.24■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.24■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HECW1Q76N89 1606 aa26.24■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.22■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUP160Q12769 1436 aa26.21■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.21■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBLN2P98095 1184 aa26.19■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DISP1Q96F81 1524 aa26.18■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.14■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.13■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.13■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHD1O14646 1710 aa26.04■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.04■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 JPH4Q96JJ6 628 aa26■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCOA2Q15596 1464 aa25.99■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.96■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.96■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF11O15085 1522 aa25.94■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.93■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITGAEP38570 1179 aa25.92■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.85■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.84■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHROOM2Q13796 1616 aa25.84■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.83■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA8O94911 1581 aa25.81■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.8■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARID3CA6NKF2 412 aa25.79■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.78■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MIA2Q96PC5 1412 aa25.77■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPRGP23470 1445 aa25.73■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.72■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.7■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.67■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HFM1A2PYH4 1435 aa25.63■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP10BO94823 1461 aa25.63■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPRKQ15262 1439 aa25.61■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF14Q15058 1648 aa25.61■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UACAQ9BZF9 1416 aa25.59■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.59■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKNAQ7Z591 1439 aa25.56■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.56■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.56■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NAIPQ13075 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC2Q92887 1545 aa25.53■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAPKBP1O60336 1514 aa25.52■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DAPK1P53355 1430 aa25.49■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.47■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.47■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROCK1Q13464 1354 aa25.44■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.43■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC5O15440 1437 aa25.42■■□□□ 1.66
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