RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.97□□□□□ -1.45
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.97□□□□□ -1.45
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.94□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1GP13640 62 aa5.94□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.94□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1MQ8N339 61 aa5.87□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.85□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.83□□□□□ -1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-9P26371 169 aa5.82□□□□□ -1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.82□□□□□ -1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A0A0MQY5 61 aa5.76□□□□□ -1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.74□□□□□ -1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.66□□□□□ -1.5
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR2BP35325 72 aa5.62□□□□□ -1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR2AP35326 72 aa5.62□□□□□ -1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.59□□□□□ -1.51
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.54□□□□□ -1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEBP20929 6669 aa5.53□□□□□ -1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MDN1Q9NU22 5596 aa5.51□□□□□ -1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR2DP22532 72 aa5.41□□□□□ -1.54
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.28□□□□□ -1.56
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1AP04731 61 aa5.24□□□□□ -1.57
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE3BQ5TA77 95 aa5.17□□□□□ -1.58
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.12□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.95□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.9□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP12-4P60329 112 aa4.86□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.81□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE4AQ5TA78 99 aa4.81□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT3P25713 68 aa4.75□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT4P47944 62 aa4.68□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.66□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.63□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE1DQ5T752 114 aa4.6□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.59□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.49□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.47□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.39□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.28□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.24□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.17□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRM1P04553 51 aa4.13□□□□□ -1.75
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.12□□□□□ -1.75
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.03□□□□□ -1.76
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.94□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.84□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.83□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-8O75690 187 aa3.81□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC5ACP98088 5654 aa3.79□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE1CQ5T751 118 aa3.78□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.75□□□□□ -1.81
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.37□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.32□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHGR1C9JFL3 82 aa2.84□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.56□□□□□ -2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.86□□□□□ -2.11
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