RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

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Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.65■■■■□ 3.78
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.8■■■□□ 2.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.72■■■□□ 2.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC9O60706 1549 aa31.43■■■□□ 2.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCRIBQ14160 1630 aa30.93■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.89■■■□□ 2.54
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.88■■■□□ 2.37
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.85■■■□□ 2.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMARCA4P51532 1647 aa29.68■■■□□ 2.34
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.51■■■□□ 2.32
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.29■■■□□ 2.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMARCA2P51531 1590 aa29.12■■■□□ 2.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.03■■■□□ 2.24
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM41Q8WV44 630 aa28.85■■■□□ 2.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMGXB3Q12766 1538 aa28.8■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCAPD3P42695 1498 aa28.76■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC8Q09428 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.48■■■□□ 2.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.37■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFTRP13569 1480 aa28.22■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDM2Q13029 1718 aa28.21■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNJ1O43426 1573 aa28.2■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EEA1Q15075 1411 aa28.15■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOP2BQ02880 1626 aa28.09■■■□□ 2.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.08■■■□□ 2.08
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SOGA1O94964 1423 aa28.04■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CUX1P39880 1505 aa27.9■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.89■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.89■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.87■■■□□ 2.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.79■■■□□ 2.04
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.04
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP162Q5TB80 1403 aa27.58■■■□□ 2.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.52■■■□□ 2
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRXQ9BXM0 1461 aa27.47■■□□□ 1.99
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CUX2O14529 1486 aa27.45■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.42■■□□□ 1.98
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARAP1Q96P48 1450 aa26.97■■□□□ 1.91
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 HRCP23327 699 aa26.94■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APLP2Q06481 763 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFT140Q96RY7 1462 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PBRM1Q86U86 1689 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.78■■□□□ 1.88
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