RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.234e-11■■■■■ 41.7
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 87.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.457e-10■□□□□ 10.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.11e-9■■□□□ 12.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.66■□□□□ 0.424e-9■■□□□ 13.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.628e-9■■□□□ 11.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.599e-9■■■■■ 111.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.27■□□□□ 0.351e-8■□□□□ 9.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.232e-8■■■■□ 20.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 71.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.267e-8■■■□□ 15.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.437e-8■■■□□ 17.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.4□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 41.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 39.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 13.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.086e-7■□□□□ 9.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 30
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 23.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 22.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.531e-6■□□□□ 8.7
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 20.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 12.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 13.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.118e-6■■■■□ 20.3
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