RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427482.6

SH3GL3-202, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL3, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3-202ENST00000427482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
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SH3GL3-202ENST00000427482 APLP2Q06481 763 aa41.17■■■■■ 4.18
SH3GL3-202ENST00000427482 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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SH3GL3-202ENST00000427482 SAMD9Q5K651 1589 aa41.06■■■■■ 4.16
SH3GL3-202ENST00000427482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
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SH3GL3-202ENST00000427482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.98■■■■■ 4.15
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SH3GL3-202ENST00000427482 TIAM1Q13009 1591 aa40.86■■■■■ 4.13
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SH3GL3-202ENST00000427482 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.82■■■■■ 4.12
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SH3GL3-202ENST00000427482 HECW1Q76N89 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
SH3GL3-202ENST00000427482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.33■■■■■ 4.05
SH3GL3-202ENST00000427482 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
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SH3GL3-202ENST00000427482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.26■■■■■ 4.04
SH3GL3-202ENST00000427482 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
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SH3GL3-202ENST00000427482 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.22■■■■■ 4.03
SH3GL3-202ENST00000427482 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
SH3GL3-202ENST00000427482 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.22■■■■■ 4.03
SH3GL3-202ENST00000427482 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.21■■■■■ 4.03
SH3GL3-202ENST00000427482 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.21■■■■■ 4.03
SH3GL3-202ENST00000427482 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
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SH3GL3-202ENST00000427482 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
SH3GL3-202ENST00000427482 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
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SH3GL3-202ENST00000427482 NCOA2Q15596 1464 aa40.05■■■■■ 4
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SH3GL3-202ENST00000427482 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.89■■■■□ 3.98
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SH3GL3-202ENST00000427482 ATP10BO94823 1461 aa39.64■■■■□ 3.94
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SH3GL3-202ENST00000427482 AKNAQ7Z591 1439 aa39.29■■■■□ 3.88
SH3GL3-202ENST00000427482 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.27■■■■□ 3.88
SH3GL3-202ENST00000427482 DAPK1P53355 1430 aa39.26■■■■□ 3.87
SH3GL3-202ENST00000427482 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
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SH3GL3-202ENST00000427482 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
SH3GL3-202ENST00000427482 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
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