RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 GRIN2BQ13224 1484 aa29.17■■■□□ 2.26
USP39-202ENST00000409025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.14■■■□□ 2.26
USP39-202ENST00000409025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
USP39-202ENST00000409025 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.12■■■□□ 2.25
USP39-202ENST00000409025 ADAMTS12P58397 1594 aa29.11■■■□□ 2.25
USP39-202ENST00000409025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
USP39-202ENST00000409025 P3H3Q8IVL6 736 aa29■■■□□ 2.23
USP39-202ENST00000409025 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.97■■■□□ 2.23
USP39-202ENST00000409025 MAP3K1Q13233 1512 aa28.94■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 SAMD9Q5K651 1589 aa28.94■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.94■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 TIAM1Q13009 1591 aa28.89■■■□□ 2.22
USP39-202ENST00000409025 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 IQGAP2Q13576 1575 aa28.87■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 FMN1Q68DA7 1419 aa28.87■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.86■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.84■■■□□ 2.21
USP39-202ENST00000409025 GRIN2AQ12879 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
USP39-202ENST00000409025 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.81■■■□□ 2.2
USP39-202ENST00000409025 SYNJ2O15056 1496 aa28.77■■■□□ 2.2
USP39-202ENST00000409025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
USP39-202ENST00000409025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.76■■■□□ 2.19
USP39-202ENST00000409025 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.75■■■□□ 2.19
USP39-202ENST00000409025 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.73■■■□□ 2.19
USP39-202ENST00000409025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
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USP39-202ENST00000409025 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
USP39-202ENST00000409025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
USP39-202ENST00000409025 FBLN2P98095 1184 aa28.63■■■□□ 2.17
USP39-202ENST00000409025 CEP170Q5SW79 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
USP39-202ENST00000409025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.6■■■□□ 2.17
USP39-202ENST00000409025 KIAA0556O60303 1618 aa28.57■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 NUP160Q12769 1436 aa28.57■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.57■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 DISP1Q96F81 1524 aa28.55■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 HECW1Q76N89 1606 aa28.54■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.52■■■□□ 2.16
USP39-202ENST00000409025 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.51■■■□□ 2.15
USP39-202ENST00000409025 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.49■■■□□ 2.15
USP39-202ENST00000409025 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.42■■■□□ 2.14
USP39-202ENST00000409025 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
USP39-202ENST00000409025 JPH4Q96JJ6 628 aa28.41■■■□□ 2.14
USP39-202ENST00000409025 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.4■■■□□ 2.14
USP39-202ENST00000409025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
USP39-202ENST00000409025 CHD1O14646 1710 aa28.36■■■□□ 2.13
USP39-202ENST00000409025 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.35■■■□□ 2.13
USP39-202ENST00000409025 NCOA2Q15596 1464 aa28.33■■■□□ 2.13
USP39-202ENST00000409025 ITGAEP38570 1179 aa28.32■■■□□ 2.12
USP39-202ENST00000409025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
USP39-202ENST00000409025 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.32■■■□□ 2.12
USP39-202ENST00000409025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
USP39-202ENST00000409025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.121e-6■□□□□ 11
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USP39-202ENST00000409025 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
USP39-202ENST00000409025 ARHGEF11O15085 1522 aa28.26■■■□□ 2.11
USP39-202ENST00000409025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.26■■■□□ 2.11
USP39-202ENST00000409025 ARID3CA6NKF2 412 aa28.22■■■□□ 2.11
USP39-202ENST00000409025 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.2■■■□□ 2.1
USP39-202ENST00000409025 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
USP39-202ENST00000409025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
USP39-202ENST00000409025 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
USP39-202ENST00000409025 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.13■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 SHROOM2Q13796 1616 aa28.13■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 ABCA8O94911 1581 aa28.12■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.12■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.12■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.11■■■□□ 2.09
USP39-202ENST00000409025 PTPRGP23470 1445 aa28.07■■■□□ 2.08
USP39-202ENST00000409025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
USP39-202ENST00000409025 MIA2Q96PC5 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
USP39-202ENST00000409025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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USP39-202ENST00000409025 PTPRKQ15262 1439 aa27.97■■■□□ 2.07
USP39-202ENST00000409025 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.97■■■□□ 2.07
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USP39-202ENST00000409025 HFM1A2PYH4 1435 aa27.92■■■□□ 2.06
USP39-202ENST00000409025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.91■■■□□ 2.06
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USP39-202ENST00000409025 KIF14Q15058 1648 aa27.89■■■□□ 2.06
USP39-202ENST00000409025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.89■■■□□ 2.06
USP39-202ENST00000409025 NAIPQ13075 1403 aa27.84■■■□□ 2.05
USP39-202ENST00000409025 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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USP39-202ENST00000409025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 DAPK1P53355 1430 aa27.78■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.77■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.77■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.77■■■□□ 2.04
USP39-202ENST00000409025 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
USP39-202ENST00000409025 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.75■■■□□ 2.03
USP39-202ENST00000409025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.74■■■□□ 2.03
USP39-202ENST00000409025 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.73■■■□□ 2.03
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