RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369306.7

PEX11B-201, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 11 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PEX11B, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11B-201ENST00000369306 GRIN2BQ13224 1484 aa23.58■■□□□ 1.36
PEX11B-201ENST00000369306 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.57■■□□□ 1.36
PEX11B-201ENST00000369306 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.56■■□□□ 1.36
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PEX11B-201ENST00000369306 ADAMTS12P58397 1594 aa23.53■■□□□ 1.36
PEX11B-201ENST00000369306 MAP3K1Q13233 1512 aa23.48■■□□□ 1.35
PEX11B-201ENST00000369306 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PEX11B-201ENST00000369306 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PEX11B-201ENST00000369306 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.44■■□□□ 1.34
PEX11B-201ENST00000369306 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PEX11B-201ENST00000369306 SAMD9Q5K651 1589 aa23.43■■□□□ 1.34
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PEX11B-201ENST00000369306 TIAM1Q13009 1591 aa23.4■■□□□ 1.34
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PEX11B-201ENST00000369306 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.37■■□□□ 1.33
PEX11B-201ENST00000369306 FMN1Q68DA7 1419 aa23.37■■□□□ 1.33
PEX11B-201ENST00000369306 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.37■■□□□ 1.33
PEX11B-201ENST00000369306 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.37■■□□□ 1.33
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PEX11B-201ENST00000369306 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
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PEX11B-201ENST00000369306 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.31■■□□□ 1.32
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PEX11B-201ENST00000369306 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PEX11B-201ENST00000369306 GRIN2AQ12879 1464 aa23.29■■□□□ 1.32
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PEX11B-201ENST00000369306 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.25■■□□□ 1.31
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PEX11B-201ENST00000369306 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PEX11B-201ENST00000369306 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.19■■□□□ 1.3
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PEX11B-201ENST00000369306 CEP170Q5SW79 1584 aa23.13■■□□□ 1.29
PEX11B-201ENST00000369306 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.12■■□□□ 1.29
PEX11B-201ENST00000369306 NUP160Q12769 1436 aa23.12■■□□□ 1.29
PEX11B-201ENST00000369306 DISP1Q96F81 1524 aa23.12■■□□□ 1.29
PEX11B-201ENST00000369306 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.1■■□□□ 1.29
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PEX11B-201ENST00000369306 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.07■■□□□ 1.28
PEX11B-201ENST00000369306 FBLN2P98095 1184 aa23.06■■□□□ 1.28
PEX11B-201ENST00000369306 HECW1Q76N89 1606 aa23.06■■□□□ 1.28
PEX11B-201ENST00000369306 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.04■■□□□ 1.28
PEX11B-201ENST00000369306 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PEX11B-201ENST00000369306 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.99■■□□□ 1.27
PEX11B-201ENST00000369306 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
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PEX11B-201ENST00000369306 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.94■■□□□ 1.26
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PEX11B-201ENST00000369306 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.94■■□□□ 1.26
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PEX11B-201ENST00000369306 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.89■■□□□ 1.25
PEX11B-201ENST00000369306 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.86■■□□□ 1.25
PEX11B-201ENST00000369306 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PEX11B-201ENST00000369306 CHD1O14646 1710 aa22.84■■□□□ 1.25
PEX11B-201ENST00000369306 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.81■■□□□ 1.24
PEX11B-201ENST00000369306 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.81■■□□□ 1.24
PEX11B-201ENST00000369306 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.8■■□□□ 1.24
PEX11B-201ENST00000369306 ARID3CA6NKF2 412 aa22.78■■□□□ 1.24
PEX11B-201ENST00000369306 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PEX11B-201ENST00000369306 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.75■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 ABCA8O94911 1581 aa22.75■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 MIA2Q96PC5 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 SHROOM2Q13796 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
PEX11B-201ENST00000369306 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PEX11B-201ENST00000369306 PTPRKQ15262 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
PEX11B-201ENST00000369306 PTPRGP23470 1445 aa22.68■■□□□ 1.22
PEX11B-201ENST00000369306 HFM1A2PYH4 1435 aa22.65■■□□□ 1.22
PEX11B-201ENST00000369306 ATP10BO94823 1461 aa22.64■■□□□ 1.21
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PEX11B-201ENST00000369306 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.62■■□□□ 1.21
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PEX11B-201ENST00000369306 DAPK1P53355 1430 aa22.49■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.48■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 ABCC5O15440 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 ABCC2Q92887 1545 aa22.47■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 ROCK1Q13464 1354 aa22.47■■□□□ 1.19
PEX11B-201ENST00000369306 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.46■■□□□ 1.19
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