RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360274.8

PRKAR1B-201, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1B, Length 2,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1B-201ENST00000360274 GRIN2BQ13224 1484 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKAR1B-201ENST00000360274 APLP2Q06481 763 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKAR1B-201ENST00000360274 ADAMTS12P58397 1594 aa43.56■■■■■ 4.56
PRKAR1B-201ENST00000360274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.52■■■■■ 4.56
PRKAR1B-201ENST00000360274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
PRKAR1B-201ENST00000360274 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.47■■■■■ 4.55
PRKAR1B-201ENST00000360274 P3H3Q8IVL6 736 aa43.31■■■■■ 4.52
PRKAR1B-201ENST00000360274 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.31■■■■■ 4.52
PRKAR1B-201ENST00000360274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.31■■■■■ 4.52
PRKAR1B-201ENST00000360274 SAMD9Q5K651 1589 aa43.28■■■■■ 4.52
PRKAR1B-201ENST00000360274 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
PRKAR1B-201ENST00000360274 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAP3K1Q13233 1512 aa43.17■■■■■ 4.5
PRKAR1B-201ENST00000360274 IQGAP2Q13576 1575 aa43.16■■■■■ 4.5
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
PRKAR1B-201ENST00000360274 TIAM1Q13009 1591 aa43.16■■■■■ 4.5
PRKAR1B-201ENST00000360274 GRIN2AQ12879 1464 aa43.1■■■■■ 4.49
PRKAR1B-201ENST00000360274 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.08■■■■■ 4.49
PRKAR1B-201ENST00000360274 FMN1Q68DA7 1419 aa43.07■■■■■ 4.49
PRKAR1B-201ENST00000360274 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.06■■■■■ 4.48
PRKAR1B-201ENST00000360274 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.05■■■■■ 4.48
PRKAR1B-201ENST00000360274 SYNJ2O15056 1496 aa43.02■■■■■ 4.48
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.96■■■■■ 4.47
PRKAR1B-201ENST00000360274 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.94■■■■■ 4.46
PRKAR1B-201ENST00000360274 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.93■■■■■ 4.46
PRKAR1B-201ENST00000360274 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
PRKAR1B-201ENST00000360274 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
PRKAR1B-201ENST00000360274 CEP170Q5SW79 1584 aa42.86■■■■■ 4.45
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
PRKAR1B-201ENST00000360274 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.79■■■■■ 4.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 FBLN2P98095 1184 aa42.77■■■■■ 4.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 NUP160Q12769 1436 aa42.74■■■■■ 4.43
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIAA0556O60303 1618 aa42.73■■■■■ 4.43
PRKAR1B-201ENST00000360274 DISP1Q96F81 1524 aa42.72■■■■■ 4.43
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.64■■■■■ 4.42
PRKAR1B-201ENST00000360274 HECW1Q76N89 1606 aa42.61■■■■■ 4.41
PRKAR1B-201ENST00000360274 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.6■■■■■ 4.41
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.54■■■■■ 4.4
PRKAR1B-201ENST00000360274 CHD1O14646 1710 aa42.49■■■■■ 4.39
PRKAR1B-201ENST00000360274 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.49■■■■■ 4.39
PRKAR1B-201ENST00000360274 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
PRKAR1B-201ENST00000360274 JPH4Q96JJ6 628 aa42.44■■■■■ 4.38
PRKAR1B-201ENST00000360274 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.43■■■■■ 4.38
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.39■■■■■ 4.38
PRKAR1B-201ENST00000360274 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.38■■■■■ 4.38
PRKAR1B-201ENST00000360274 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.37■■■■■ 4.37
PRKAR1B-201ENST00000360274 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
PRKAR1B-201ENST00000360274 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PRKAR1B-201ENST00000360274 NCOA2Q15596 1464 aa42.32■■■■■ 4.36
PRKAR1B-201ENST00000360274 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
PRKAR1B-201ENST00000360274 ITGAEP38570 1179 aa42.25■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.24■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARHGEF11O15085 1522 aa42.23■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARID3CA6NKF2 412 aa42.21■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.19■■■■■ 4.35
PRKAR1B-201ENST00000360274 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.19■■■■■ 4.34
PRKAR1B-201ENST00000360274 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.17■■■■■ 4.34
PRKAR1B-201ENST00000360274 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
PRKAR1B-201ENST00000360274 SHROOM2Q13796 1616 aa42.12■■■■■ 4.33
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCA8O94911 1581 aa42.06■■■■■ 4.32
PRKAR1B-201ENST00000360274 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42■■■■■ 4.31
PRKAR1B-201ENST00000360274 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
PRKAR1B-201ENST00000360274 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PRKAR1B-201ENST00000360274 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.94■■■■■ 4.31
PRKAR1B-201ENST00000360274 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.94■■■■■ 4.3
PRKAR1B-201ENST00000360274 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.93■■■■■ 4.3
PRKAR1B-201ENST00000360274 PTPRGP23470 1445 aa41.92■■■■■ 4.3
PRKAR1B-201ENST00000360274 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
PRKAR1B-201ENST00000360274 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
PRKAR1B-201ENST00000360274 MIA2Q96PC5 1412 aa41.86■■■■■ 4.29
PRKAR1B-201ENST00000360274 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.85■■■■■ 4.29
PRKAR1B-201ENST00000360274 PTPRKQ15262 1439 aa41.82■■■■■ 4.29
PRKAR1B-201ENST00000360274 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.81■■■■■ 4.28
PRKAR1B-201ENST00000360274 ATP10BO94823 1461 aa41.81■■■■■ 4.28
PRKAR1B-201ENST00000360274 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.81■■■■■ 4.28
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIF14Q15058 1648 aa41.75■■■■■ 4.27
PRKAR1B-201ENST00000360274 UACAQ9BZF9 1416 aa41.69■■■■■ 4.27
PRKAR1B-201ENST00000360274 HFM1A2PYH4 1435 aa41.66■■■■■ 4.26
PRKAR1B-201ENST00000360274 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.65■■■■■ 4.26
PRKAR1B-201ENST00000360274 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.64■■■■■ 4.26
PRKAR1B-201ENST00000360274 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC2Q92887 1545 aa41.57■■■■■ 4.25
PRKAR1B-201ENST00000360274 NAIPQ13075 1403 aa41.56■■■■■ 4.24
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAPKBP1O60336 1514 aa41.56■■■■■ 4.24
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.52■■■■■ 4.24
PRKAR1B-201ENST00000360274 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.49■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.48■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 DAPK1P53355 1430 aa41.47■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.47■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 AKNAQ7Z591 1439 aa41.46■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.45■■■■■ 4.23
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC5O15440 1437 aa41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms