RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337221.8

SCARA3-202, Transcript of scavenger receptor class A member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARA3, Length 1,910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3-202ENST00000337221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.48■■■■■ 4.55
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SCARA3-202ENST00000337221 HRCP23327 699 aa43.42■■■■■ 4.54
SCARA3-202ENST00000337221 APLP2Q06481 763 aa43.42■■■■■ 4.54
SCARA3-202ENST00000337221 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.38■■■■■ 4.54
SCARA3-202ENST00000337221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.24■■■■■ 4.51
SCARA3-202ENST00000337221 SAMD9Q5K651 1589 aa43.19■■■■■ 4.51
SCARA3-202ENST00000337221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.19■■■■■ 4.5
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SCARA3-202ENST00000337221 SYNJ2O15056 1496 aa42.97■■■■■ 4.47
SCARA3-202ENST00000337221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.97■■■■■ 4.47
SCARA3-202ENST00000337221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.92■■■■■ 4.46
SCARA3-202ENST00000337221 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.92■■■■■ 4.46
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SCARA3-202ENST00000337221 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.82■■■■■ 4.45
SCARA3-202ENST00000337221 CEP170Q5SW79 1584 aa42.79■■■■■ 4.44
SCARA3-202ENST00000337221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
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SCARA3-202ENST00000337221 DISP1Q96F81 1524 aa42.66■■■■■ 4.42
SCARA3-202ENST00000337221 KIAA0556O60303 1618 aa42.66■■■■■ 4.42
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SCARA3-202ENST00000337221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.45■■■■■ 4.39
SCARA3-202ENST00000337221 CHD1O14646 1710 aa42.43■■■■■ 4.38
SCARA3-202ENST00000337221 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
SCARA3-202ENST00000337221 JPH4Q96JJ6 628 aa42.39■■■■■ 4.38
SCARA3-202ENST00000337221 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.37■■■■■ 4.37
SCARA3-202ENST00000337221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SCARA3-202ENST00000337221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.33■■■■■ 4.37
SCARA3-202ENST00000337221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.32■■■■■ 4.37
SCARA3-202ENST00000337221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.28■■■■■ 4.36
SCARA3-202ENST00000337221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.28■■■■■ 4.36
SCARA3-202ENST00000337221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
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SCARA3-202ENST00000337221 NCOA2Q15596 1464 aa42.2■■■■■ 4.35
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SCARA3-202ENST00000337221 SHROOM2Q13796 1616 aa42.09■■■■■ 4.33
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SCARA3-202ENST00000337221 ITGAEP38570 1179 aa42.05■■■■■ 4.32
SCARA3-202ENST00000337221 ABCA8O94911 1581 aa42.01■■■■■ 4.32
SCARA3-202ENST00000337221 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.93■■■■■ 4.3
SCARA3-202ENST00000337221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.87■■■■■ 4.29
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SCARA3-202ENST00000337221 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.8■■■■■ 4.28
SCARA3-202ENST00000337221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.79■■■■■ 4.28
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SCARA3-202ENST00000337221 MIA2Q96PC5 1412 aa41.78■■■■■ 4.28
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SCARA3-202ENST00000337221 AKNAQ7Z591 1439 aa41.39■■■■■ 4.22
SCARA3-202ENST00000337221 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.39■■■■■ 4.22
SCARA3-202ENST00000337221 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
SCARA3-202ENST00000337221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.38■■■■■ 4.21
SCARA3-202ENST00000337221 DAPK1P53355 1430 aa41.36■■■■■ 4.21
SCARA3-202ENST00000337221 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SCARA3-202ENST00000337221 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.36■■■■■ 4.21
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SCARA3-202ENST00000337221 ABCC5O15440 1437 aa41.32■■■■■ 4.21
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