RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.82■■■□□ 2.36
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS12P58397 1594 aa29.81■■■□□ 2.36
UPP1-201ENST00000331803 APLP2Q06481 763 aa29.75■■■□□ 2.35
UPP1-201ENST00000331803 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.71■■■□□ 2.35
UPP1-201ENST00000331803 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.67■■■□□ 2.34
UPP1-201ENST00000331803 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
UPP1-201ENST00000331803 P3H3Q8IVL6 736 aa29.64■■■□□ 2.34
UPP1-201ENST00000331803 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.58■■■□□ 2.33
UPP1-201ENST00000331803 GRIN2AQ12879 1464 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-201ENST00000331803 SYNJ2O15056 1496 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-201ENST00000331803 SAMD9Q5K651 1589 aa29.54■■■□□ 2.32
UPP1-201ENST00000331803 IQGAP2Q13576 1575 aa29.53■■■□□ 2.32
UPP1-201ENST00000331803 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.47■■■□□ 2.31
UPP1-201ENST00000331803 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
UPP1-201ENST00000331803 FBLN2P98095 1184 aa29.45■■■□□ 2.31
UPP1-201ENST00000331803 FMN1Q68DA7 1419 aa29.45■■■□□ 2.31
UPP1-201ENST00000331803 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K1Q13233 1512 aa29.42■■■□□ 2.3
UPP1-201ENST00000331803 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-201ENST00000331803 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-201ENST00000331803 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-201ENST00000331803 TIAM1Q13009 1591 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-201ENST00000331803 HRCP23327 699 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-201ENST00000331803 CEP170Q5SW79 1584 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-201ENST00000331803 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UPP1-201ENST00000331803 NUP160Q12769 1436 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-201ENST00000331803 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.27■■■□□ 2.28
UPP1-201ENST00000331803 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.26■■■□□ 2.27
UPP1-201ENST00000331803 DISP1Q96F81 1524 aa29.25■■■□□ 2.27
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0556O60303 1618 aa29.22■■■□□ 2.27
UPP1-201ENST00000331803 JPH4Q96JJ6 628 aa29.19■■■□□ 2.26
UPP1-201ENST00000331803 CHD1O14646 1710 aa29.14■■■□□ 2.26
UPP1-201ENST00000331803 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.12■■■□□ 2.25
UPP1-201ENST00000331803 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
UPP1-201ENST00000331803 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.1■■■□□ 2.25
UPP1-201ENST00000331803 HECW1Q76N89 1606 aa29.09■■■□□ 2.25
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
UPP1-201ENST00000331803 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.06■■■□□ 2.24
UPP1-201ENST00000331803 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.04■■■□□ 2.24
UPP1-201ENST00000331803 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.04■■■□□ 2.24
UPP1-201ENST00000331803 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-201ENST00000331803 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-201ENST00000331803 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.91■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 ARID3CA6NKF2 412 aa28.9■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.9■■■□□ 2.22
UPP1-201ENST00000331803 SHROOM2Q13796 1616 aa28.88■■■□□ 2.21
UPP1-201ENST00000331803 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
UPP1-201ENST00000331803 NCOA2Q15596 1464 aa28.86■■■□□ 2.21
UPP1-201ENST00000331803 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.81■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 PTPRGP23470 1445 aa28.81■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 ITGAEP38570 1179 aa28.79■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF11O15085 1522 aa28.79■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.79■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 ABCA8O94911 1581 aa28.79■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.77■■■□□ 2.2
UPP1-201ENST00000331803 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.7■■■□□ 2.19
UPP1-201ENST00000331803 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
UPP1-201ENST00000331803 ATP10BO94823 1461 aa28.65■■■□□ 2.18
UPP1-201ENST00000331803 UACAQ9BZF9 1416 aa28.63■■■□□ 2.17
UPP1-201ENST00000331803 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.6■■■□□ 2.17
UPP1-201ENST00000331803 MIA2Q96PC5 1412 aa28.59■■■□□ 2.17
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.59■■■□□ 2.17
UPP1-201ENST00000331803 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
UPP1-201ENST00000331803 OSCARQ8IYS5 282 aa28.55■■■□□ 2.16
UPP1-201ENST00000331803 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.53■■■□□ 2.16
UPP1-201ENST00000331803 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.53■■■□□ 2.16
UPP1-201ENST00000331803 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.51■■■□□ 2.15
UPP1-201ENST00000331803 ABCC2Q92887 1545 aa28.51■■■□□ 2.15
UPP1-201ENST00000331803 KIF14Q15058 1648 aa28.49■■■□□ 2.15
UPP1-201ENST00000331803 PTPRKQ15262 1439 aa28.48■■■□□ 2.15
UPP1-201ENST00000331803 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
UPP1-201ENST00000331803 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
UPP1-201ENST00000331803 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.43■■■□□ 2.14
UPP1-201ENST00000331803 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.4■■■□□ 2.14
UPP1-201ENST00000331803 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
UPP1-201ENST00000331803 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.39■■■□□ 2.14
UPP1-201ENST00000331803 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.39■■■□□ 2.13
UPP1-201ENST00000331803 HFM1A2PYH4 1435 aa28.37■■■□□ 2.13
UPP1-201ENST00000331803 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
UPP1-201ENST00000331803 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.33■■■□□ 2.13
UPP1-201ENST00000331803 NAIPQ13075 1403 aa28.31■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.31■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.31■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.3■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 DAPK1P53355 1430 aa28.29■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms