RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.1■■■■■ 4.49
UPP1-201ENST00000331803 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.45■■■■□ 3.59
UPP1-201ENST00000331803 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
UPP1-201ENST00000331803 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.68■■■■□ 3.3
UPP1-201ENST00000331803 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.6■■■■□ 3.29
UPP1-201ENST00000331803 ABCC9O60706 1549 aa35.4■■■■□ 3.26
UPP1-201ENST00000331803 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.33■■■■□ 3.25
UPP1-201ENST00000331803 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.12■■■■□ 3.21
UPP1-201ENST00000331803 NACADO15069 1562 aa34.89■■■■□ 3.18
UPP1-201ENST00000331803 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.56■■■■□ 3.12
UPP1-201ENST00000331803 SCRIBQ14160 1630 aa34.53■■■■□ 3.12
UPP1-201ENST00000331803 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
UPP1-201ENST00000331803 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.86■■■■□ 3.01
UPP1-201ENST00000331803 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.53■■■□□ 2.96
UPP1-201ENST00000331803 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
UPP1-201ENST00000331803 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.51■■■□□ 2.95
UPP1-201ENST00000331803 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.95
UPP1-201ENST00000331803 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.32■■■□□ 2.92
UPP1-201ENST00000331803 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
UPP1-201ENST00000331803 SMARCA4P51532 1647 aa33.08■■■□□ 2.89
UPP1-201ENST00000331803 WIZO95785 1651 aa33.04■■■□□ 2.88
UPP1-201ENST00000331803 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
UPP1-201ENST00000331803 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.67■■■□□ 2.82
UPP1-201ENST00000331803 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.66■■■□□ 2.82
UPP1-201ENST00000331803 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
UPP1-201ENST00000331803 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
UPP1-201ENST00000331803 SMARCA2P51531 1590 aa32.49■■■□□ 2.79
UPP1-201ENST00000331803 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.39■■■□□ 2.78
UPP1-201ENST00000331803 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UPP1-201ENST00000331803 NCAPD3P42695 1498 aa32.23■■■□□ 2.75
UPP1-201ENST00000331803 HMGXB3Q12766 1538 aa32.16■■■□□ 2.74
UPP1-201ENST00000331803 TRIM41Q8WV44 630 aa32.02■■■□□ 2.72
UPP1-201ENST00000331803 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.01■■■□□ 2.71
UPP1-201ENST00000331803 ABCC8Q09428 1581 aa31.75■■■□□ 2.67
UPP1-201ENST00000331803 CFTRP13569 1480 aa31.56■■■□□ 2.64
UPP1-201ENST00000331803 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
UPP1-201ENST00000331803 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.47■■■□□ 2.63
UPP1-201ENST00000331803 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
UPP1-201ENST00000331803 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.44■■■□□ 2.62
UPP1-201ENST00000331803 SYNJ1O43426 1573 aa31.38■■■□□ 2.61
UPP1-201ENST00000331803 PRDM2Q13029 1718 aa31.32■■■□□ 2.6
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.25■■■□□ 2.59
UPP1-201ENST00000331803 TOP2BQ02880 1626 aa31.23■■■□□ 2.59
UPP1-201ENST00000331803 SOGA1O94964 1423 aa31.21■■■□□ 2.59
UPP1-201ENST00000331803 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.18■■■□□ 2.58
UPP1-201ENST00000331803 CUX1P39880 1505 aa31.13■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 EEA1Q15075 1411 aa31.13■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 NESP48681 1621 aa31.12■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.09■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-201ENST00000331803 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-201ENST00000331803 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-201ENST00000331803 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.88■■■□□ 2.53
UPP1-201ENST00000331803 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.85■■■□□ 2.53
UPP1-201ENST00000331803 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.79■■■□□ 2.52
UPP1-201ENST00000331803 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.78■■■□□ 2.52
UPP1-201ENST00000331803 TOPBP1Q92547 1522 aa30.74■■■□□ 2.51
UPP1-201ENST00000331803 KIF27Q86VH2 1401 aa30.73■■■□□ 2.51
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA3Q08378 1498 aa30.72■■■□□ 2.51
UPP1-201ENST00000331803 KIF21BO75037 1637 aa30.7■■■□□ 2.5
UPP1-201ENST00000331803 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.69■■■□□ 2.5
UPP1-201ENST00000331803 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
UPP1-201ENST00000331803 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.67■■■□□ 2.5
UPP1-201ENST00000331803 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
UPP1-201ENST00000331803 CUX2O14529 1486 aa30.62■■■□□ 2.49
UPP1-201ENST00000331803 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.56■■■□□ 2.48
UPP1-201ENST00000331803 PRXQ9BXM0 1461 aa30.54■■■□□ 2.48
UPP1-201ENST00000331803 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.54■■■□□ 2.48
UPP1-201ENST00000331803 CEP162Q5TB80 1403 aa30.51■■■□□ 2.47
UPP1-201ENST00000331803 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.5■■■□□ 2.47
UPP1-201ENST00000331803 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-201ENST00000331803 IGF1RP08069 1367 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-201ENST00000331803 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-201ENST00000331803 WDR97A6NE52 1622 aa30.34■■■□□ 2.45
UPP1-201ENST00000331803 ERCC6Q03468 1493 aa30.33■■■□□ 2.45
UPP1-201ENST00000331803 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.31■■■□□ 2.44
UPP1-201ENST00000331803 WDR62O43379 1518 aa30.27■■■□□ 2.44
UPP1-201ENST00000331803 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
UPP1-201ENST00000331803 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
UPP1-201ENST00000331803 CLIP1P30622 1438 aa30.25■■■□□ 2.43
UPP1-201ENST00000331803 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.21■■■□□ 2.43
UPP1-201ENST00000331803 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.2■■■□□ 2.42
UPP1-201ENST00000331803 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.16■■■□□ 2.42
UPP1-201ENST00000331803 CUL7Q14999 1698 aa30.14■■■□□ 2.42
UPP1-201ENST00000331803 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
UPP1-201ENST00000331803 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
UPP1-201ENST00000331803 IFT140Q96RY7 1462 aa30.11■■■□□ 2.41
UPP1-201ENST00000331803 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
UPP1-201ENST00000331803 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
UPP1-201ENST00000331803 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.99■■■□□ 2.39
UPP1-201ENST00000331803 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
UPP1-201ENST00000331803 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
UPP1-201ENST00000331803 PBRM1Q86U86 1689 aa29.96■■■□□ 2.39
UPP1-201ENST00000331803 GRIN2BQ13224 1484 aa29.93■■■□□ 2.38
UPP1-201ENST00000331803 ARAP1Q96P48 1450 aa29.92■■■□□ 2.38
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
UPP1-201ENST00000331803 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.86■■■□□ 2.37
UPP1-201ENST00000331803 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms