RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA3-201ENST00000317201 GRIN2BQ13224 1484 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 ARAP1Q96P48 1450 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 ADAMTS12P58397 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA3-201ENST00000317201 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA3-201ENST00000317201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXA3-201ENST00000317201 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXA3-201ENST00000317201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA3-201ENST00000317201 SAMD9Q5K651 1589 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA3-201ENST00000317201 APLP2Q06481 763 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K1Q13233 1512 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA3-201ENST00000317201 SYNJ2O15056 1496 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA3-201ENST00000317201 GRIN2AQ12879 1464 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA3-201ENST00000317201 IQGAP2Q13576 1575 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA3-201ENST00000317201 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA3-201ENST00000317201 FMN1Q68DA7 1419 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA3-201ENST00000317201 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA3-201ENST00000317201 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 TIAM1Q13009 1591 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 NUP160Q12769 1436 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXA3-201ENST00000317201 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXA3-201ENST00000317201 CEP170Q5SW79 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXA3-201ENST00000317201 P3H3Q8IVL6 736 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXA3-201ENST00000317201 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA0556O60303 1618 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA3-201ENST00000317201 DISP1Q96F81 1524 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXA3-201ENST00000317201 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXA3-201ENST00000317201 FBLN2P98095 1184 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 HECW1Q76N89 1606 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 CHD1O14646 1710 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXA3-201ENST00000317201 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXA3-201ENST00000317201 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA3-201ENST00000317201 JPH4Q96JJ6 628 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA3-201ENST00000317201 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 SHROOM2Q13796 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA3-201ENST00000317201 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF11O15085 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA8O94911 1581 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXA3-201ENST00000317201 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXA3-201ENST00000317201 NCOA2Q15596 1464 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXA3-201ENST00000317201 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXA3-201ENST00000317201 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRGP23470 1445 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 MIA2Q96PC5 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXA3-201ENST00000317201 UACAQ9BZF9 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 ATP10BO94823 1461 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC2Q92887 1545 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.45■■□□□ 1.03
HOXA3-201ENST00000317201 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 ARID3CA6NKF2 412 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 KIF14Q15058 1648 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXA3-201ENST00000317201 ITGAEP38570 1179 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 OSCARQ8IYS5 282 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.36■■□□□ 1.01
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