RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXA3-201ENST00000317201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA3-201ENST00000317201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA3-201ENST00000317201 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA3-201ENST00000317201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC9O60706 1549 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-201ENST00000317201 NACADO15069 1562 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXA3-201ENST00000317201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA3-201ENST00000317201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA3-201ENST00000317201 SCRIBQ14160 1630 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXA3-201ENST00000317201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA3-201ENST00000317201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXA3-201ENST00000317201 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA3-201ENST00000317201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXA3-201ENST00000317201 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXA3-201ENST00000317201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXA3-201ENST00000317201 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA3-201ENST00000317201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
HOXA3-201ENST00000317201 SMARCA4P51532 1647 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA3-201ENST00000317201 WIZO95785 1651 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA3-201ENST00000317201 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXA3-201ENST00000317201 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXA3-201ENST00000317201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXA3-201ENST00000317201 SMARCA2P51531 1590 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXA3-201ENST00000317201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXA3-201ENST00000317201 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXA3-201ENST00000317201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA3-201ENST00000317201 NCAPD3P42695 1498 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA3-201ENST00000317201 HMGXB3Q12766 1538 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA3-201ENST00000317201 HRCP23327 699 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXA3-201ENST00000317201 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXA3-201ENST00000317201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA3-201ENST00000317201 MYT1Q01538 1121 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM41Q8WV44 630 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC8Q09428 1581 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA3-201ENST00000317201 CFTRP13569 1480 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA3-201ENST00000317201 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXA3-201ENST00000317201 PRDM2Q13029 1718 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA3-201ENST00000317201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
HOXA3-201ENST00000317201 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA3-201ENST00000317201 SYNJ1O43426 1573 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA3-201ENST00000317201 TOP2BQ02880 1626 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA3-201ENST00000317201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA3-201ENST00000317201 EEA1Q15075 1411 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA3-201ENST00000317201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA3-201ENST00000317201 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA3-201ENST00000317201 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA3-201ENST00000317201 CUX1P39880 1505 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA3-201ENST00000317201 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXA3-201ENST00000317201 SOGA1O94964 1423 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA3-201ENST00000317201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA3-201ENST00000317201 NESP48681 1621 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA3-201ENST00000317201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA3-201ENST00000317201 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA3-201ENST00000317201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA3-201ENST00000317201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA3-201ENST00000317201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXA3-201ENST00000317201 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXA3-201ENST00000317201 KIF21BO75037 1637 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA3-201ENST00000317201 TOPBP1Q92547 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA3-201ENST00000317201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA3-201ENST00000317201 KIF27Q86VH2 1401 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA3Q08378 1498 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA3-201ENST00000317201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA3-201ENST00000317201 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA3-201ENST00000317201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA3-201ENST00000317201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23■■□□□ 1.27
HOXA3-201ENST00000317201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXA3-201ENST00000317201 PRXQ9BXM0 1461 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA3-201ENST00000317201 CUX2O14529 1486 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA3-201ENST00000317201 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA3-201ENST00000317201 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA3-201ENST00000317201 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA3-201ENST00000317201 WDR97A6NE52 1622 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA3-201ENST00000317201 CEP162Q5TB80 1403 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA3-201ENST00000317201 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-201ENST00000317201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-201ENST00000317201 IGF1RP08069 1367 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-201ENST00000317201 WDR62O43379 1518 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-201ENST00000317201 BCL11AQ9H165 835 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXA3-201ENST00000317201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXA3-201ENST00000317201 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXA3-201ENST00000317201 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXA3-201ENST00000317201 CUL7Q14999 1698 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA3-201ENST00000317201 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA3-201ENST00000317201 ERCC6Q03468 1493 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA3-201ENST00000317201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXA3-201ENST00000317201 CLIP1P30622 1438 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 IFT140Q96RY7 1462 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 NEUROD1Q13562 356 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXA3-201ENST00000317201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXA3-201ENST00000317201 PBRM1Q86U86 1689 aa22.56■■□□□ 1.2
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