RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.99■■■■□ 3.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.86■■■■□ 3.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APLP2Q06481 763 aa33.85■■■■□ 3.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD9Q5K651 1589 aa33.83■■■■□ 3.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQGAP2Q13576 1575 aa33.74■■■□□ 2.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K1Q13233 1512 aa33.73■■■□□ 2.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIN2AQ12879 1464 aa33.72■■■□□ 2.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.7■■■□□ 2.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNJ2O15056 1496 aa33.69■■■□□ 2.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMN1Q68DA7 1419 aa33.63■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HRCP23327 699 aa33.63■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.63■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIAM1Q13009 1591 aa33.63■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.62■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P3H3Q8IVL6 736 aa33.6■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.6■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.59■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.59■■■□□ 2.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP170Q5SW79 1584 aa33.51■■■□□ 2.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP160Q12769 1436 aa33.48■■■□□ 2.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.44■■■□□ 2.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0556O60303 1618 aa33.4■■■□□ 2.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DISP1Q96F81 1524 aa33.38■■■□□ 2.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.35■■■□□ 2.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBLN2P98095 1184 aa33.32■■■□□ 2.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HECW1Q76N89 1606 aa33.29■■■□□ 2.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHD1O14646 1710 aa33.28■■■□□ 2.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.24■■■□□ 2.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.16■■■□□ 2.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.16■■■□□ 2.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JPH4Q96JJ6 628 aa33.15■■■□□ 2.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.12■■■□□ 2.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.11■■■□□ 2.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.11■■■□□ 2.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.09■■■□□ 2.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHROOM2Q13796 1616 aa33.04■■■□□ 2.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.02■■■□□ 2.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF11O15085 1522 aa32.98■■■□□ 2.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCOA2Q15596 1464 aa32.96■■■□□ 2.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.91■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCA8O94911 1581 aa32.91■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.9■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.89■■■□□ 2.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.87■■■□□ 2.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRGP23470 1445 aa32.76■■■□□ 2.84
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.72■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID3CA6NKF2 412 aa32.72■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.71■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIA2Q96PC5 1412 aa32.69■■■□□ 2.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.69■■■□□ 2.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGAEP38570 1179 aa32.67■■■□□ 2.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP10BO94823 1461 aa32.65■■■□□ 2.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UACAQ9BZF9 1416 aa32.62■■■□□ 2.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.59■■■□□ 2.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.56■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.55■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC2Q92887 1545 aa32.55■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF14Q15058 1648 aa32.55■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.54■■■□□ 2.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRKQ15262 1439 aa32.5■■■□□ 2.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.48■■■□□ 2.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.47■■■□□ 2.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HFM1A2PYH4 1435 aa32.45■■■□□ 2.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.43■■■□□ 2.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.4■■■□□ 2.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKNAQ7Z591 1439 aa32.39■■■□□ 2.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.35■■■□□ 2.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSCARQ8IYS5 282 aa32.35■■■□□ 2.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAIPQ13075 1403 aa32.34■■■□□ 2.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.33■■■□□ 2.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.32■■■□□ 2.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAPK1P53355 1430 aa32.31■■■□□ 2.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms