RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.24■■■■■ 5.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.92■■■■■ 4.46
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.79■■■■■ 4.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.36■■■■■ 4.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.24■■■■■ 4.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC9O60706 1549 aa40.21■■■■■ 4.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.15■■■■■ 4.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NACADO15069 1562 aa39.87■■■■□ 3.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.45■■■■□ 3.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCRIBQ14160 1630 aa39.38■■■■□ 3.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.74■■■■□ 3.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.28■■■■□ 3.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCA4P51532 1647 aa37.82■■■■□ 3.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WIZO95785 1651 aa37.74■■■■□ 3.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.41■■■■□ 3.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.27■■■■□ 3.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCA2P51531 1590 aa37.13■■■■□ 3.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.11■■■■□ 3.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.95■■■■□ 3.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGXB3Q12766 1538 aa36.78■■■■□ 3.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPD3P42695 1498 aa36.77■■■■□ 3.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.47■■■■□ 3.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM41Q8WV44 630 aa36.45■■■■□ 3.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC8Q09428 1581 aa36.24■■■■□ 3.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFTRP13569 1480 aa36.02■■■■□ 3.36
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.99■■■■□ 3.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDM2Q13029 1718 aa35.95■■■■□ 3.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNJ1O43426 1573 aa35.87■■■■□ 3.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.81■■■■□ 3.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.79■■■■□ 3.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP2BQ02880 1626 aa35.74■■■■□ 3.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.72■■■■□ 3.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEA1Q15075 1411 aa35.64■■■■□ 3.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOGA1O94964 1423 aa35.58■■■■□ 3.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUX1P39880 1505 aa35.55■■■■□ 3.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.51■■■■□ 3.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.43■■■■□ 3.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.42■■■■□ 3.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NESP48681 1621 aa35.39■■■■□ 3.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.36■■■■□ 3.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.33■■■■□ 3.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF21BO75037 1637 aa35.2■■■■□ 3.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.19■■■■□ 3.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.18■■■■□ 3.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.17■■■■□ 3.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.13■■■■□ 3.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA3Q08378 1498 aa35.13■■■■□ 3.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.11■■■■□ 3.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOPBP1Q92547 1522 aa35.08■■■■□ 3.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF27Q86VH2 1401 aa35.07■■■■□ 3.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.05■■■■□ 3.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRXQ9BXM0 1461 aa34.91■■■■□ 3.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUX2O14529 1486 aa34.9■■■■□ 3.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.88■■■■□ 3.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP162Q5TB80 1403 aa34.87■■■■□ 3.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.84■■■■□ 3.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR97A6NE52 1622 aa34.77■■■■□ 3.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.76■■■■□ 3.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.72■■■■□ 3.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGF1RP08069 1367 aa34.71■■■■□ 3.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.57■■■■□ 3.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR62O43379 1518 aa34.57■■■■□ 3.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIP1P30622 1438 aa34.55■■■■□ 3.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.54■■■■□ 3.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL7Q14999 1698 aa34.52■■■■□ 3.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERCC6Q03468 1493 aa34.46■■■■□ 3.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.42■■■■□ 3.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.37■■■■□ 3.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT140Q96RY7 1462 aa34.34■■■■□ 3.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.3■■■■□ 3.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PBRM1Q86U86 1689 aa34.28■■■■□ 3.08
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARAP1Q96P48 1450 aa34.21■■■■□ 3.07
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.18■■■■□ 3.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.16■■■■□ 3.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIN2BQ13224 1484 aa34.13■■■■□ 3.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS12P58397 1594 aa34.09■■■■□ 3.05
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms