RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 ADAMTS12P58397 1594 aa30.96■■■□□ 2.55
UBXN6-201ENST00000301281 GRIN2BQ13224 1484 aa30.92■■■□□ 2.54
UBXN6-201ENST00000301281 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.92■■■□□ 2.54
UBXN6-201ENST00000301281 APLP2Q06481 763 aa30.91■■■□□ 2.54
UBXN6-201ENST00000301281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
UBXN6-201ENST00000301281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.89■■■□□ 2.54
UBXN6-201ENST00000301281 SAMD9Q5K651 1589 aa30.79■■■□□ 2.52
UBXN6-201ENST00000301281 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.78■■■□□ 2.52
UBXN6-201ENST00000301281 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
UBXN6-201ENST00000301281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.73■■■□□ 2.51
UBXN6-201ENST00000301281 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
UBXN6-201ENST00000301281 TIAM1Q13009 1591 aa30.71■■■□□ 2.51
UBXN6-201ENST00000301281 MAP3K1Q13233 1512 aa30.71■■■□□ 2.51
UBXN6-201ENST00000301281 P3H3Q8IVL6 736 aa30.7■■■□□ 2.51
UBXN6-201ENST00000301281 IQGAP2Q13576 1575 aa30.66■■■□□ 2.5
UBXN6-201ENST00000301281 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.66■■■□□ 2.5
UBXN6-201ENST00000301281 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.64■■■□□ 2.5
UBXN6-201ENST00000301281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
UBXN6-201ENST00000301281 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.6■■■□□ 2.49
UBXN6-201ENST00000301281 FMN1Q68DA7 1419 aa30.6■■■□□ 2.49
UBXN6-201ENST00000301281 GRIN2AQ12879 1464 aa30.6■■■□□ 2.49
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.53■■■□□ 2.48
UBXN6-201ENST00000301281 SYNJ2O15056 1496 aa30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-201ENST00000301281 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.48■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.46■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
UBXN6-201ENST00000301281 CEP170Q5SW79 1584 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN6-201ENST00000301281 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
UBXN6-201ENST00000301281 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA0556O60303 1618 aa30.38■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 DISP1Q96F81 1524 aa30.35■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 NUP160Q12769 1436 aa30.34■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.33■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
UBXN6-201ENST00000301281 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN6-201ENST00000301281 HECW1Q76N89 1606 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN6-201ENST00000301281 FBLN2P98095 1184 aa30.26■■■□□ 2.43
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.23■■■□□ 2.43
UBXN6-201ENST00000301281 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.19■■■□□ 2.42
UBXN6-201ENST00000301281 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.17■■■□□ 2.42
UBXN6-201ENST00000301281 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-201ENST00000301281 CHD1O14646 1710 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-201ENST00000301281 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-201ENST00000301281 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
UBXN6-201ENST00000301281 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
UBXN6-201ENST00000301281 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.11■■■□□ 2.41
UBXN6-201ENST00000301281 NCOA2Q15596 1464 aa30.09■■■□□ 2.41
UBXN6-201ENST00000301281 ARHGEF11O15085 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
UBXN6-201ENST00000301281 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
UBXN6-201ENST00000301281 JPH4Q96JJ6 628 aa30.05■■■□□ 2.4
UBXN6-201ENST00000301281 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.05■■■□□ 2.4
UBXN6-201ENST00000301281 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.04■■■□□ 2.4
UBXN6-201ENST00000301281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.393e-6■■■■□ 21.7
UBXN6-201ENST00000301281 ITGAEP38570 1179 aa29.98■■■□□ 2.39
UBXN6-201ENST00000301281 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.98■■■□□ 2.39
UBXN6-201ENST00000301281 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
UBXN6-201ENST00000301281 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.96■■■□□ 2.39
UBXN6-201ENST00000301281 SHROOM2Q13796 1616 aa29.92■■■□□ 2.38
UBXN6-201ENST00000301281 ARID3CA6NKF2 412 aa29.92■■■□□ 2.38
UBXN6-201ENST00000301281 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
UBXN6-201ENST00000301281 ABCA8O94911 1581 aa29.88■■■□□ 2.37
UBXN6-201ENST00000301281 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
UBXN6-201ENST00000301281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.87■■■□□ 2.37
UBXN6-201ENST00000301281 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.84■■■□□ 2.37
UBXN6-201ENST00000301281 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.81■■■□□ 2.36
UBXN6-201ENST00000301281 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
UBXN6-201ENST00000301281 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-201ENST00000301281 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.75■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 PTPRKQ15262 1439 aa29.75■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 MIA2Q96PC5 1412 aa29.74■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.74■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.72■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 PTPRGP23470 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
UBXN6-201ENST00000301281 KIF14Q15058 1648 aa29.69■■■□□ 2.34
UBXN6-201ENST00000301281 ATP10BO94823 1461 aa29.67■■■□□ 2.34
UBXN6-201ENST00000301281 HFM1A2PYH4 1435 aa29.64■■■□□ 2.34
UBXN6-201ENST00000301281 MAPKBP1O60336 1514 aa29.63■■■□□ 2.33
UBXN6-201ENST00000301281 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.61■■■□□ 2.33
UBXN6-201ENST00000301281 UACAQ9BZF9 1416 aa29.57■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 NAIPQ13075 1403 aa29.57■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC2Q92887 1545 aa29.52■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 AKNAQ7Z591 1439 aa29.52■■■□□ 2.32
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.51■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.5■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.49■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.48■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 DAPK1P53355 1430 aa29.48■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC5O15440 1437 aa29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-201ENST00000301281 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
UBXN6-201ENST00000301281 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms