RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 APLP2Q06481 763 aa31.89■■■□□ 2.7
RCN3-201ENST00000270645 ADAMTS12P58397 1594 aa31.88■■■□□ 2.69
RCN3-201ENST00000270645 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
RCN3-201ENST00000270645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
RCN3-201ENST00000270645 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.8■■■□□ 2.68
RCN3-201ENST00000270645 HRCP23327 699 aa31.78■■■□□ 2.68
RCN3-201ENST00000270645 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.75■■■□□ 2.67
RCN3-201ENST00000270645 P3H3Q8IVL6 736 aa31.72■■■□□ 2.67
RCN3-201ENST00000270645 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.68■■■□□ 2.66
RCN3-201ENST00000270645 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
RCN3-201ENST00000270645 SAMD9Q5K651 1589 aa31.65■■■□□ 2.66
RCN3-201ENST00000270645 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
RCN3-201ENST00000270645 MAP3K1Q13233 1512 aa31.6■■■□□ 2.65
RCN3-201ENST00000270645 GRIN2AQ12879 1464 aa31.59■■■□□ 2.65
RCN3-201ENST00000270645 IQGAP2Q13576 1575 aa31.59■■■□□ 2.65
RCN3-201ENST00000270645 SYNJ2O15056 1496 aa31.56■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 FMN1Q68DA7 1419 aa31.54■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.52■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 TIAM1Q13009 1591 aa31.51■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.51■■■□□ 2.64
RCN3-201ENST00000270645 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.51■■■□□ 2.63
RCN3-201ENST00000270645 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
RCN3-201ENST00000270645 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.46■■■□□ 2.63
RCN3-201ENST00000270645 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
RCN3-201ENST00000270645 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.39■■■□□ 2.62
RCN3-201ENST00000270645 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.39■■■□□ 2.62
RCN3-201ENST00000270645 FBLN2P98095 1184 aa31.39■■■□□ 2.62
RCN3-201ENST00000270645 CEP170Q5SW79 1584 aa31.39■■■□□ 2.62
RCN3-201ENST00000270645 NUP160Q12769 1436 aa31.36■■■□□ 2.61
RCN3-201ENST00000270645 DISP1Q96F81 1524 aa31.3■■■□□ 2.6
RCN3-201ENST00000270645 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
RCN3-201ENST00000270645 KIAA0556O60303 1618 aa31.27■■■□□ 2.6
RCN3-201ENST00000270645 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
RCN3-201ENST00000270645 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
RCN3-201ENST00000270645 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.2■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 JPH4Q96JJ6 628 aa31.18■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.18■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.15■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 HECW1Q76N89 1606 aa31.15■■■□□ 2.58
RCN3-201ENST00000270645 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.13■■■□□ 2.57
RCN3-201ENST00000270645 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
RCN3-201ENST00000270645 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.1■■■□□ 2.57
RCN3-201ENST00000270645 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.1■■■□□ 2.57
RCN3-201ENST00000270645 CHD1O14646 1710 aa31.09■■■□□ 2.57
RCN3-201ENST00000270645 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
RCN3-201ENST00000270645 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.01■■■□□ 2.56
RCN3-201ENST00000270645 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.99■■■□□ 2.55
RCN3-201ENST00000270645 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.98■■■□□ 2.55
RCN3-201ENST00000270645 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
RCN3-201ENST00000270645 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
RCN3-201ENST00000270645 NCOA2Q15596 1464 aa30.94■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.9■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 ARHGEF11O15085 1522 aa30.9■■■□□ 2.54
RCN3-201ENST00000270645 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.88■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 ARID3CA6NKF2 412 aa30.88■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 SHROOM2Q13796 1616 aa30.87■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 ITGAEP38570 1179 aa30.86■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.85■■■□□ 2.53
RCN3-201ENST00000270645 ABCA8O94911 1581 aa30.82■■■□□ 2.52
RCN3-201ENST00000270645 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
RCN3-201ENST00000270645 PTPRGP23470 1445 aa30.78■■■□□ 2.52
RCN3-201ENST00000270645 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.77■■■□□ 2.52
RCN3-201ENST00000270645 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.67■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 ATP10BO94823 1461 aa30.66■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 MIA2Q96PC5 1412 aa30.66■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.66■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.66■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.64■■■□□ 2.5
RCN3-201ENST00000270645 UACAQ9BZF9 1416 aa30.6■■■□□ 2.49
RCN3-201ENST00000270645 PTPRKQ15262 1439 aa30.58■■■□□ 2.49
RCN3-201ENST00000270645 OSCARQ8IYS5 282 aa30.57■■■□□ 2.48
RCN3-201ENST00000270645 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.57■■■□□ 2.48
RCN3-201ENST00000270645 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.57■■■□□ 2.48
RCN3-201ENST00000270645 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.56■■■□□ 2.48
RCN3-201ENST00000270645 KIF14Q15058 1648 aa30.5■■■□□ 2.47
RCN3-201ENST00000270645 ABCC2Q92887 1545 aa30.47■■■□□ 2.47
RCN3-201ENST00000270645 HFM1A2PYH4 1435 aa30.46■■■□□ 2.47
RCN3-201ENST00000270645 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
RCN3-201ENST00000270645 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.41■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.41■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 NAIPQ13075 1403 aa30.4■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
RCN3-201ENST00000270645 AKNAQ7Z591 1439 aa30.34■■■□□ 2.45
RCN3-201ENST00000270645 DAPK1P53355 1430 aa30.34■■■□□ 2.45
RCN3-201ENST00000270645 ABCC5O15440 1437 aa30.32■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.32■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.32■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 MAPKBP1O60336 1514 aa30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 631 ms