RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.15■■■■■ 4.98
RCN3-201ENST00000270645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.04■■■■■ 4
RCN3-201ENST00000270645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
RCN3-201ENST00000270645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.14■■■■□ 3.7
RCN3-201ENST00000270645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.08■■■■□ 3.69
RCN3-201ENST00000270645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.85■■■■□ 3.65
RCN3-201ENST00000270645 ABCC9O60706 1549 aa37.73■■■■□ 3.63
RCN3-201ENST00000270645 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.59■■■■□ 3.61
RCN3-201ENST00000270645 NACADO15069 1562 aa37.28■■■■□ 3.56
RCN3-201ENST00000270645 SCRIBQ14160 1630 aa36.91■■■■□ 3.5
RCN3-201ENST00000270645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.89■■■■□ 3.5
RCN3-201ENST00000270645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
RCN3-201ENST00000270645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.14■■■■□ 3.38
RCN3-201ENST00000270645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
RCN3-201ENST00000270645 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.87■■■■□ 3.33
RCN3-201ENST00000270645 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.82■■■■□ 3.32
RCN3-201ENST00000270645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.31e-7■■■■■ 32.7
RCN3-201ENST00000270645 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.68■■■■□ 3.3
RCN3-201ENST00000270645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
RCN3-201ENST00000270645 SMARCA4P51532 1647 aa35.39■■■■□ 3.26
RCN3-201ENST00000270645 WIZO95785 1651 aa35.37■■■■□ 3.25
RCN3-201ENST00000270645 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.15■■■■□ 3.22
RCN3-201ENST00000270645 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
RCN3-201ENST00000270645 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.96■■■■□ 3.19
RCN3-201ENST00000270645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.79■■■■□ 3.16
RCN3-201ENST00000270645 SMARCA2P51531 1590 aa34.73■■■■□ 3.15
RCN3-201ENST00000270645 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.7■■■■□ 3.15
RCN3-201ENST00000270645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
RCN3-201ENST00000270645 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
RCN3-201ENST00000270645 NCAPD3P42695 1498 aa34.45■■■■□ 3.11
RCN3-201ENST00000270645 HMGXB3Q12766 1538 aa34.37■■■■□ 3.09
RCN3-201ENST00000270645 TRIM41Q8WV44 630 aa34.34■■■■□ 3.09
RCN3-201ENST00000270645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.13■■■■□ 3.05
RCN3-201ENST00000270645 ABCC8Q09428 1581 aa34.02■■■■□ 3.04
RCN3-201ENST00000270645 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.84■■■■□ 3.01
RCN3-201ENST00000270645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
RCN3-201ENST00000270645 CFTRP13569 1480 aa33.75■■■□□ 2.99
RCN3-201ENST00000270645 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
RCN3-201ENST00000270645 SYNJ1O43426 1573 aa33.62■■■□□ 2.97
RCN3-201ENST00000270645 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.6■■■□□ 2.97
RCN3-201ENST00000270645 PRDM2Q13029 1718 aa33.48■■■□□ 2.95
RCN3-201ENST00000270645 SOGA1O94964 1423 aa33.48■■■□□ 2.95
RCN3-201ENST00000270645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.46■■■□□ 2.95
RCN3-201ENST00000270645 TOP2BQ02880 1626 aa33.45■■■□□ 2.95
RCN3-201ENST00000270645 EEA1Q15075 1411 aa33.41■■■□□ 2.94
RCN3-201ENST00000270645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.39■■■□□ 2.94
RCN3-201ENST00000270645 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.34■■■□□ 2.93
RCN3-201ENST00000270645 CUX1P39880 1505 aa33.33■■■□□ 2.93
RCN3-201ENST00000270645 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.27■■■□□ 2.92
RCN3-201ENST00000270645 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.25■■■□□ 2.91
RCN3-201ENST00000270645 NESP48681 1621 aa33.22■■■□□ 2.91
RCN3-201ENST00000270645 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.2■■■□□ 2.91
RCN3-201ENST00000270645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.19■■■□□ 2.9
RCN3-201ENST00000270645 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.96■■■□□ 2.87
RCN3-201ENST00000270645 GOLGA3Q08378 1498 aa32.96■■■□□ 2.87
RCN3-201ENST00000270645 KIF21BO75037 1637 aa32.95■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.95■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.95■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.92■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.92■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 KIF27Q86VH2 1401 aa32.9■■■□□ 2.86
RCN3-201ENST00000270645 TOPBP1Q92547 1522 aa32.87■■■□□ 2.85
RCN3-201ENST00000270645 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
RCN3-201ENST00000270645 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
RCN3-201ENST00000270645 CUX2O14529 1486 aa32.76■■■□□ 2.84
RCN3-201ENST00000270645 PRXQ9BXM0 1461 aa32.76■■■□□ 2.84
RCN3-201ENST00000270645 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.76■■■□□ 2.84
RCN3-201ENST00000270645 CEP162Q5TB80 1403 aa32.76■■■□□ 2.84
RCN3-201ENST00000270645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.75■■■□□ 2.83
RCN3-201ENST00000270645 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
RCN3-201ENST00000270645 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
RCN3-201ENST00000270645 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.65■■■□□ 2.82
RCN3-201ENST00000270645 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.64■■■□□ 2.82
RCN3-201ENST00000270645 IGF1RP08069 1367 aa32.64■■■□□ 2.82
RCN3-201ENST00000270645 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.51■■■□□ 2.8
RCN3-201ENST00000270645 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.5■■■□□ 2.79
RCN3-201ENST00000270645 CLIP1P30622 1438 aa32.46■■■□□ 2.79
RCN3-201ENST00000270645 WDR97A6NE52 1622 aa32.46■■■□□ 2.79
RCN3-201ENST00000270645 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.45■■■□□ 2.79
RCN3-201ENST00000270645 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
RCN3-201ENST00000270645 ERCC6Q03468 1493 aa32.41■■■□□ 2.78
RCN3-201ENST00000270645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
RCN3-201ENST00000270645 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
RCN3-201ENST00000270645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.32■■■□□ 2.76
RCN3-201ENST00000270645 WDR62O43379 1518 aa32.32■■■□□ 2.76
RCN3-201ENST00000270645 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.28■■■□□ 2.76
RCN3-201ENST00000270645 CUL7Q14999 1698 aa32.26■■■□□ 2.75
RCN3-201ENST00000270645 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
RCN3-201ENST00000270645 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.21■■■□□ 2.75
RCN3-201ENST00000270645 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
RCN3-201ENST00000270645 IFT140Q96RY7 1462 aa32.16■■■□□ 2.74
RCN3-201ENST00000270645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
RCN3-201ENST00000270645 ARAP1Q96P48 1450 aa32.12■■■□□ 2.73
RCN3-201ENST00000270645 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
RCN3-201ENST00000270645 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.07■■■□□ 2.72
RCN3-201ENST00000270645 PBRM1Q86U86 1689 aa32.01■■■□□ 2.71
RCN3-201ENST00000270645 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
RCN3-201ENST00000270645 GRIN2BQ13224 1484 aa31.98■■■□□ 2.71
RCN3-201ENST00000270645 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.94■■■□□ 2.7
RCN3-201ENST00000270645 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms