RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238721.8

TP53I3-201, Transcript of tumor protein p53 inducible protein 3, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53I3, Length 1,998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53I3-201	ENST00000238721	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		37.83	■■■■□ 3.65
TP53I3-201	ENST00000238721	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		37.79	■■■■□ 3.64
TP53I3-201	ENST00000238721	ADAMTS12	P58397	1594 aa		37.77	■■■■□ 3.64
TP53I3-201	ENST00000238721	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	37.75	■■■■□ 3.63
TP53I3-201	ENST00000238721	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		37.65	■■■■□ 3.62
TP53I3-201	ENST00000238721	P3H3	Q8IVL6	736 aa		37.64	■■■■□ 3.62
TP53I3-201	ENST00000238721	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		37.63	■■■■□ 3.61
TP53I3-201	ENST00000238721	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		37.55	■■■■□ 3.6
TP53I3-201	ENST00000238721	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	37.52	■■■■□ 3.6
TP53I3-201	ENST00000238721	HRC	P23327	699 aa		37.48	■■■■□ 3.59
TP53I3-201	ENST00000238721	GRIN2A	Q12879	1464 aa		37.44	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	SAMD9	Q5K651	1589 aa		37.43	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	IQGAP2	Q13576	1575 aa		37.42	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	37.41	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	37.41	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	SYNJ2	O15056	1496 aa		37.4	■■■■□ 3.58
TP53I3-201	ENST00000238721	FMN1	Q68DA7	1419 aa		37.35	■■■■□ 3.57
TP53I3-201	ENST00000238721	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	37.35	■■■■□ 3.57
TP53I3-201	ENST00000238721	FBLN2	P98095	1184 aa		37.34	■■■■□ 3.57
TP53I3-201	ENST00000238721	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	37.32	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		37.31	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	MAP3K1	Q13233	1512 aa		37.3	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		37.29	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		37.29	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	TIAM1	Q13009	1591 aa		37.28	■■■■□ 3.56
TP53I3-201	ENST00000238721	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		37.23	■■■■□ 3.55
TP53I3-201	ENST00000238721	CEP170	Q5SW79	1584 aa		37.18	■■■■□ 3.54
TP53I3-201	ENST00000238721	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		37.14	■■■■□ 3.54
TP53I3-201	ENST00000238721	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		37.14	■■■■□ 3.54
TP53I3-201	ENST00000238721	NUP160	Q12769	1436 aa		37.13	■■■■□ 3.53
TP53I3-201	ENST00000238721	DISP1	Q96F81	1524 aa		37.05	■■■■□ 3.52
TP53I3-201	ENST00000238721	KIAA0556	O60303	1618 aa		37.03	■■■■□ 3.52
TP53I3-201	ENST00000238721	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	37.02	■■■■□ 3.52
TP53I3-201	ENST00000238721	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	36.97	■■■■□ 3.51
TP53I3-201	ENST00000238721	JPH4	Q96JJ6	628 aa		36.96	■■■■□ 3.51
TP53I3-201	ENST00000238721	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	36.92	■■■■□ 3.5
TP53I3-201	ENST00000238721	HECW1	Q76N89	1606 aa		36.9	■■■■□ 3.5
TP53I3-201	ENST00000238721	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	36.89	■■■■□ 3.5
TP53I3-201	ENST00000238721	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		36.89	■■■■□ 3.5
TP53I3-201	ENST00000238721	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		36.89	■■■■□ 3.5
TP53I3-201	ENST00000238721	CHD1	O14646	1710 aa		36.88	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		36.87	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		36.87	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		36.86	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		36.85	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	36.84	■■■■□ 3.49
TP53I3-201	ENST00000238721	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	36.78	■■■■□ 3.48
TP53I3-201	ENST00000238721	ARID3C	A6NKF2	412 aa		36.73	■■■■□ 3.47
TP53I3-201	ENST00000238721	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		36.72	■■■■□ 3.47
TP53I3-201	ENST00000238721	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		36.71	■■■■□ 3.47
TP53I3-201	ENST00000238721	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	36.7	■■■■□ 3.47
TP53I3-201	ENST00000238721	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	36.68	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	36.66	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		36.65	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	ITGAE	P38570	1179 aa		36.64	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	36.64	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	NCOA2	Q15596	1464 aa		36.64	■■■■□ 3.46
TP53I3-201	ENST00000238721	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		36.62	■■■■□ 3.45
TP53I3-201	ENST00000238721	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	36.62	■■■■□ 3.45
TP53I3-201	ENST00000238721	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		36.55	■■■■□ 3.44
TP53I3-201	ENST00000238721	SHROOM2	Q13796	1616 aa		36.53	■■■■□ 3.44
TP53I3-201	ENST00000238721	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		36.51	■■■■□ 3.44
TP53I3-201	ENST00000238721	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	36.51	■■■■□ 3.43
TP53I3-201	ENST00000238721	ARHGEF11	O15085	1522 aa		36.5	■■■■□ 3.43
TP53I3-201	ENST00000238721	PTPRG	P23470	1445 aa		36.49	■■■■□ 3.43
TP53I3-201	ENST00000238721	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	36.49	■■■■□ 3.43
TP53I3-201	ENST00000238721	ABCA8	O94911	1581 aa		36.47	■■■■□ 3.43
TP53I3-201	ENST00000238721	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		36.44	■■■■□ 3.42
TP53I3-201	ENST00000238721	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		36.34	■■■■□ 3.41
TP53I3-201	ENST00000238721	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	36.33	■■■■□ 3.41
TP53I3-201	ENST00000238721	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		36.3	■■■■□ 3.4
TP53I3-201	ENST00000238721	ATP10B	O94823	1461 aa		36.29	■■■■□ 3.4
TP53I3-201	ENST00000238721	UACA	Q9BZF9	1416 aa		36.26	■■■■□ 3.4
TP53I3-201	ENST00000238721	MIA2	Q96PC5	1412 aa		36.26	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		36.26	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		36.24	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		36.24	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	36.23	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	36.21	■■■■□ 3.39
TP53I3-201	ENST00000238721	PTPRK	Q15262	1439 aa		36.15	■■■■□ 3.38
TP53I3-201	ENST00000238721	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		36.15	■■■■□ 3.38
TP53I3-201	ENST00000238721	KIF14	Q15058	1648 aa		36.13	■■■■□ 3.37
TP53I3-201	ENST00000238721	ABCC2	Q92887	1545 aa		36.1	■■■■□ 3.37
TP53I3-201	ENST00000238721	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		36.09	■■■■□ 3.37
TP53I3-201	ENST00000238721	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		36.09	■■■■□ 3.37
TP53I3-201	ENST00000238721	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	36.04	■■■■□ 3.36
TP53I3-201	ENST00000238721	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	36.04	■■■■□ 3.36
TP53I3-201	ENST00000238721	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		36.02	■■■■□ 3.36
TP53I3-201	ENST00000238721	HFM1	A2PYH4	1435 aa		36.01	■■■■□ 3.36
TP53I3-201	ENST00000238721	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	36	■■■■□ 3.35
TP53I3-201	ENST00000238721	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		35.98	■■■■□ 3.35
TP53I3-201	ENST00000238721	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		35.97	■■■■□ 3.35
TP53I3-201	ENST00000238721	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		35.97	■■■■□ 3.35
TP53I3-201	ENST00000238721	NAIP	Q13075	1403 aa		35.93	■■■■□ 3.34
TP53I3-201	ENST00000238721	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	35.92	■■■■□ 3.34
TP53I3-201	ENST00000238721	DAPK1	P53355	1430 aa		35.91	■■■■□ 3.34
TP53I3-201	ENST00000238721	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		35.91	■■■■□ 3.34
TP53I3-201	ENST00000238721	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		35.9	■■■■□ 3.34
TP53I3-201	ENST00000238721	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	35.88	■■■■□ 3.33
TP53I3-201	ENST00000238721	ABCC5	O15440	1437 aa		35.88	■■■■□ 3.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms